Protein–RNA interactions for Protein: P51512

MMP16, Matrix metalloproteinase-16, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP16P51512 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP16P51512 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP16P51512 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP16P51512 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MMP16P51512 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MMP16P51512 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP16P51512 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP16P51512 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP16P51512 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP16P51512 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP16P51512 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP16P51512 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP16P51512 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MMP16P51512 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP16P51512 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP16P51512 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP16P51512 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MMP16P51512 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP16P51512 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP16P51512 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP16P51512 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP16P51512 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MMP16P51512 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP16P51512 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP16P51512 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP16P51512 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP16P51512 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP16P51512 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP16P51512 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP16P51512 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MMP16P51512 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP16P51512 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP16P51512 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP16P51512 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP16P51512 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP16P51512 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP16P51512 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP16P51512 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP16P51512 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP16P51512 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP16P51512 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP16P51512 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP16P51512 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP16P51512 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP16P51512 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP16P51512 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP16P51512 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP16P51512 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP16P51512 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP16P51512 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP16P51512 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP16P51512 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP16P51512 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP16P51512 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP16P51512 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP16P51512 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP16P51512 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP16P51512 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP16P51512 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP16P51512 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP16P51512 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP16P51512 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP16P51512 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP16P51512 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP16P51512 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP16P51512 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP16P51512 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP16P51512 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP16P51512 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP16P51512 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP16P51512 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP16P51512 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP16P51512 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP16P51512 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP16P51512 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP16P51512 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP16P51512 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP16P51512 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP16P51512 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP16P51512 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP16P51512 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP16P51512 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP16P51512 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP16P51512 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP16P51512 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP16P51512 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP16P51512 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP16P51512 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP16P51512 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP16P51512 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP16P51512 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP16P51512 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP16P51512 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP16P51512 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP16P51512 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP16P51512 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP16P51512 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP16P51512 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP16P51512 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP16P51512 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms