Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL4P36578 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL4P36578 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL4P36578 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL4P36578 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL4P36578 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL4P36578 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL4P36578 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL4P36578 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL4P36578 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL4P36578 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL4P36578 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL4P36578 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL4P36578 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL4P36578 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL4P36578 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL4P36578 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPL4P36578 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL4P36578 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL4P36578 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL4P36578 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL4P36578 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL4P36578 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL4P36578 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL4P36578 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL4P36578 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL4P36578 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL4P36578 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL4P36578 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL4P36578 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL4P36578 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL4P36578 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL4P36578 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL4P36578 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL4P36578 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL4P36578 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL4P36578 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL4P36578 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL4P36578 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL4P36578 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL4P36578 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL4P36578 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL4P36578 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL4P36578 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL4P36578 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL4P36578 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL4P36578 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL4P36578 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL4P36578 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPL4P36578 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL4P36578 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL4P36578 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL4P36578 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL4P36578 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL4P36578 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL4P36578 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL4P36578 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL4P36578 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL4P36578 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL4P36578 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL4P36578 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL4P36578 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL4P36578 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL4P36578 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL4P36578 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL4P36578 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL4P36578 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL4P36578 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL4P36578 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL4P36578 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL4P36578 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL4P36578 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL4P36578 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL4P36578 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL4P36578 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL4P36578 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL4P36578 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL4P36578 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL4P36578 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL4P36578 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL4P36578 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL4P36578 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL4P36578 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL4P36578 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL4P36578 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL4P36578 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL4P36578 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL4P36578 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL4P36578 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL4P36578 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL4P36578 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL4P36578 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL4P36578 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL4P36578 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL4P36578 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL4P36578 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL4P36578 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL4P36578 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL4P36578 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL4P36578 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms