Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNCP24821 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNCP24821 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNCP24821 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNCP24821 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNCP24821 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNCP24821 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNCP24821 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNCP24821 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNCP24821 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNCP24821 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNCP24821 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNCP24821 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNCP24821 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNCP24821 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNCP24821 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNCP24821 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNCP24821 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNCP24821 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TNCP24821 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNCP24821 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNCP24821 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNCP24821 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNCP24821 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNCP24821 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNCP24821 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNCP24821 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNCP24821 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNCP24821 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNCP24821 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNCP24821 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNCP24821 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNCP24821 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNCP24821 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNCP24821 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNCP24821 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNCP24821 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNCP24821 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNCP24821 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNCP24821 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNCP24821 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNCP24821 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNCP24821 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNCP24821 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNCP24821 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNCP24821 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNCP24821 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNCP24821 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNCP24821 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNCP24821 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNCP24821 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNCP24821 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNCP24821 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNCP24821 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNCP24821 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNCP24821 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNCP24821 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNCP24821 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNCP24821 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNCP24821 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNCP24821 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNCP24821 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNCP24821 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNCP24821 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNCP24821 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNCP24821 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNCP24821 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNCP24821 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TNCP24821 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNCP24821 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNCP24821 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNCP24821 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNCP24821 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNCP24821 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNCP24821 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNCP24821 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNCP24821 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TNCP24821 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNCP24821 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNCP24821 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNCP24821 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNCP24821 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNCP24821 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNCP24821 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNCP24821 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNCP24821 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNCP24821 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNCP24821 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNCP24821 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNCP24821 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNCP24821 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNCP24821 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNCP24821 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNCP24821 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNCP24821 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNCP24821 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNCP24821 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNCP24821 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNCP24821 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNCP24821 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms