Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STMN1P16949 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STMN1P16949 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STMN1P16949 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STMN1P16949 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STMN1P16949 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STMN1P16949 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STMN1P16949 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STMN1P16949 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STMN1P16949 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STMN1P16949 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
STMN1P16949 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STMN1P16949 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STMN1P16949 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STMN1P16949 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STMN1P16949 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STMN1P16949 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STMN1P16949 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STMN1P16949 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STMN1P16949 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STMN1P16949 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STMN1P16949 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
STMN1P16949 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
STMN1P16949 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
STMN1P16949 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STMN1P16949 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STMN1P16949 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STMN1P16949 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
STMN1P16949 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STMN1P16949 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STMN1P16949 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STMN1P16949 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STMN1P16949 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STMN1P16949 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STMN1P16949 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
STMN1P16949 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STMN1P16949 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STMN1P16949 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STMN1P16949 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STMN1P16949 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STMN1P16949 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STMN1P16949 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STMN1P16949 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
STMN1P16949 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STMN1P16949 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STMN1P16949 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STMN1P16949 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STMN1P16949 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STMN1P16949 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STMN1P16949 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STMN1P16949 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STMN1P16949 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
STMN1P16949 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
STMN1P16949 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
STMN1P16949 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STMN1P16949 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STMN1P16949 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STMN1P16949 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STMN1P16949 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STMN1P16949 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STMN1P16949 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STMN1P16949 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STMN1P16949 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STMN1P16949 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STMN1P16949 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STMN1P16949 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STMN1P16949 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STMN1P16949 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STMN1P16949 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STMN1P16949 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STMN1P16949 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STMN1P16949 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STMN1P16949 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STMN1P16949 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
STMN1P16949 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STMN1P16949 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STMN1P16949 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STMN1P16949 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STMN1P16949 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
STMN1P16949 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STMN1P16949 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STMN1P16949 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STMN1P16949 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STMN1P16949 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STMN1P16949 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STMN1P16949 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STMN1P16949 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STMN1P16949 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STMN1P16949 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STMN1P16949 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STMN1P16949 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STMN1P16949 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STMN1P16949 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STMN1P16949 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STMN1P16949 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STMN1P16949 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STMN1P16949 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STMN1P16949 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STMN1P16949 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STMN1P16949 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.2 ms