Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GFAPP14136 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GFAPP14136 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GFAPP14136 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GFAPP14136 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GFAPP14136 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GFAPP14136 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GFAPP14136 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GFAPP14136 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GFAPP14136 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GFAPP14136 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GFAPP14136 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GFAPP14136 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GFAPP14136 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GFAPP14136 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GFAPP14136 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GFAPP14136 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GFAPP14136 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GFAPP14136 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GFAPP14136 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GFAPP14136 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GFAPP14136 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GFAPP14136 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GFAPP14136 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GFAPP14136 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GFAPP14136 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GFAPP14136 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GFAPP14136 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GFAPP14136 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GFAPP14136 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GFAPP14136 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GFAPP14136 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GFAPP14136 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GFAPP14136 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GFAPP14136 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GFAPP14136 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GFAPP14136 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GFAPP14136 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GFAPP14136 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GFAPP14136 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GFAPP14136 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GFAPP14136 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GFAPP14136 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GFAPP14136 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GFAPP14136 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GFAPP14136 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GFAPP14136 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GFAPP14136 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GFAPP14136 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GFAPP14136 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GFAPP14136 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GFAPP14136 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GFAPP14136 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GFAPP14136 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GFAPP14136 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GFAPP14136 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GFAPP14136 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GFAPP14136 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GFAPP14136 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GFAPP14136 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GFAPP14136 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GFAPP14136 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GFAPP14136 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GFAPP14136 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GFAPP14136 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GFAPP14136 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GFAPP14136 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GFAPP14136 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GFAPP14136 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GFAPP14136 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GFAPP14136 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GFAPP14136 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GFAPP14136 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GFAPP14136 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GFAPP14136 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GFAPP14136 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GFAPP14136 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GFAPP14136 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GFAPP14136 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GFAPP14136 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GFAPP14136 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GFAPP14136 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GFAPP14136 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GFAPP14136 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GFAPP14136 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GFAPP14136 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GFAPP14136 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GFAPP14136 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GFAPP14136 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GFAPP14136 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GFAPP14136 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GFAPP14136 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GFAPP14136 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GFAPP14136 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GFAPP14136 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GFAPP14136 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GFAPP14136 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GFAPP14136 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GFAPP14136 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GFAPP14136 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms