Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB1P08183 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB1P08183 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB1P08183 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB1P08183 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB1P08183 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB1P08183 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB1P08183 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB1P08183 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB1P08183 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB1P08183 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB1P08183 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB1P08183 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB1P08183 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB1P08183 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB1P08183 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB1P08183 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB1P08183 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABCB1P08183 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCB1P08183 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCB1P08183 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCB1P08183 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABCB1P08183 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ABCB1P08183 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ABCB1P08183 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ABCB1P08183 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms