Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
THY1P04216 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THY1P04216 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
THY1P04216 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
THY1P04216 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THY1P04216 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
THY1P04216 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THY1P04216 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THY1P04216 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
THY1P04216 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THY1P04216 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
THY1P04216 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THY1P04216 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THY1P04216 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THY1P04216 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THY1P04216 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THY1P04216 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THY1P04216 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THY1P04216 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THY1P04216 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
THY1P04216 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THY1P04216 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THY1P04216 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THY1P04216 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THY1P04216 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THY1P04216 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THY1P04216 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
THY1P04216 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THY1P04216 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THY1P04216 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THY1P04216 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THY1P04216 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THY1P04216 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THY1P04216 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THY1P04216 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
THY1P04216 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THY1P04216 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THY1P04216 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
THY1P04216 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THY1P04216 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
THY1P04216 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THY1P04216 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
THY1P04216 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THY1P04216 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
THY1P04216 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
THY1P04216 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
THY1P04216 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
THY1P04216 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THY1P04216 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THY1P04216 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
THY1P04216 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THY1P04216 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THY1P04216 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
THY1P04216 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THY1P04216 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
THY1P04216 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
THY1P04216 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THY1P04216 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THY1P04216 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THY1P04216 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THY1P04216 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THY1P04216 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THY1P04216 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
THY1P04216 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THY1P04216 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
THY1P04216 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
THY1P04216 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
THY1P04216 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THY1P04216 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
THY1P04216 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THY1P04216 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THY1P04216 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THY1P04216 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
THY1P04216 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THY1P04216 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
THY1P04216 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THY1P04216 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
THY1P04216 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THY1P04216 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THY1P04216 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THY1P04216 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THY1P04216 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
THY1P04216 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
THY1P04216 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THY1P04216 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
THY1P04216 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THY1P04216 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THY1P04216 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
THY1P04216 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
THY1P04216 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
THY1P04216 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
THY1P04216 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THY1P04216 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
THY1P04216 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THY1P04216 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
THY1P04216 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THY1P04216 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THY1P04216 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
THY1P04216 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
THY1P04216 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms