Protein–RNA interactions for Protein: O95872

GPANK1, G patch domain and ankyrin repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPANK1O95872 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GPANK1O95872 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPANK1O95872 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPANK1O95872 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPANK1O95872 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms