Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSC2O15499 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSC2O15499 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSC2O15499 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSC2O15499 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSC2O15499 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSC2O15499 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSC2O15499 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSC2O15499 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSC2O15499 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSC2O15499 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSC2O15499 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSC2O15499 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSC2O15499 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GSC2O15499 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSC2O15499 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSC2O15499 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSC2O15499 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSC2O15499 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSC2O15499 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSC2O15499 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSC2O15499 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSC2O15499 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSC2O15499 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSC2O15499 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSC2O15499 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSC2O15499 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSC2O15499 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSC2O15499 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSC2O15499 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSC2O15499 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSC2O15499 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSC2O15499 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSC2O15499 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSC2O15499 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSC2O15499 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSC2O15499 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSC2O15499 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSC2O15499 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSC2O15499 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSC2O15499 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GSC2O15499 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSC2O15499 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSC2O15499 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSC2O15499 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSC2O15499 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSC2O15499 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSC2O15499 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSC2O15499 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSC2O15499 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSC2O15499 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSC2O15499 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSC2O15499 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSC2O15499 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSC2O15499 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSC2O15499 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSC2O15499 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSC2O15499 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSC2O15499 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSC2O15499 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSC2O15499 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSC2O15499 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSC2O15499 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSC2O15499 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSC2O15499 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSC2O15499 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSC2O15499 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSC2O15499 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSC2O15499 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSC2O15499 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GSC2O15499 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GSC2O15499 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSC2O15499 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSC2O15499 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSC2O15499 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSC2O15499 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSC2O15499 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSC2O15499 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GSC2O15499 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSC2O15499 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSC2O15499 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSC2O15499 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSC2O15499 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSC2O15499 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSC2O15499 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSC2O15499 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSC2O15499 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GSC2O15499 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSC2O15499 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSC2O15499 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSC2O15499 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSC2O15499 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSC2O15499 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSC2O15499 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSC2O15499 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSC2O15499 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GSC2O15499 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSC2O15499 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSC2O15499 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSC2O15499 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms