Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GSC2O15499 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GSC2O15499 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GSC2O15499 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
GSC2O15499 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GSC2O15499 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GSC2O15499 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GSC2O15499 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GSC2O15499 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GSC2O15499 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GSC2O15499 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GSC2O15499 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GSC2O15499 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GSC2O15499 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GSC2O15499 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GSC2O15499 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
GSC2O15499 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GSC2O15499 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GSC2O15499 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
GSC2O15499 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GSC2O15499 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GSC2O15499 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GSC2O15499 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GSC2O15499 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GSC2O15499 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GSC2O15499 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GSC2O15499 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GSC2O15499 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GSC2O15499 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GSC2O15499 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GSC2O15499 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GSC2O15499 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GSC2O15499 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GSC2O15499 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GSC2O15499 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GSC2O15499 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GSC2O15499 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GSC2O15499 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GSC2O15499 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GSC2O15499 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GSC2O15499 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GSC2O15499 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GSC2O15499 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GSC2O15499 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GSC2O15499 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GSC2O15499 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GSC2O15499 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GSC2O15499 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GSC2O15499 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GSC2O15499 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GSC2O15499 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GSC2O15499 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GSC2O15499 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GSC2O15499 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GSC2O15499 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GSC2O15499 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GSC2O15499 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GSC2O15499 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GSC2O15499 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GSC2O15499 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GSC2O15499 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GSC2O15499 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GSC2O15499 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GSC2O15499 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GSC2O15499 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GSC2O15499 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GSC2O15499 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GSC2O15499 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GSC2O15499 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GSC2O15499 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GSC2O15499 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GSC2O15499 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GSC2O15499 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GSC2O15499 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GSC2O15499 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GSC2O15499 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GSC2O15499 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GSC2O15499 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GSC2O15499 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GSC2O15499 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GSC2O15499 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GSC2O15499 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GSC2O15499 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GSC2O15499 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GSC2O15499 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GSC2O15499 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GSC2O15499 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GSC2O15499 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GSC2O15499 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GSC2O15499 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GSC2O15499 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GSC2O15499 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GSC2O15499 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GSC2O15499 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GSC2O15499 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GSC2O15499 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GSC2O15499 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GSC2O15499 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GSC2O15499 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GSC2O15499 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms