Protein–RNA interactions for Protein: O00445

SYT5, Synaptotagmin-5, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT5O00445 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT5O00445 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT5O00445 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT5O00445 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT5O00445 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT5O00445 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT5O00445 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT5O00445 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYT5O00445 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT5O00445 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT5O00445 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT5O00445 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT5O00445 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT5O00445 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT5O00445 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT5O00445 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT5O00445 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT5O00445 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT5O00445 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT5O00445 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT5O00445 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT5O00445 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT5O00445 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT5O00445 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT5O00445 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYT5O00445 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT5O00445 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT5O00445 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT5O00445 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT5O00445 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT5O00445 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYT5O00445 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT5O00445 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT5O00445 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT5O00445 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYT5O00445 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SYT5O00445 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT5O00445 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYT5O00445 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT5O00445 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT5O00445 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT5O00445 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT5O00445 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT5O00445 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYT5O00445 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT5O00445 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYT5O00445 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT5O00445 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT5O00445 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT5O00445 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT5O00445 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT5O00445 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT5O00445 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYT5O00445 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT5O00445 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT5O00445 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT5O00445 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT5O00445 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYT5O00445 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT5O00445 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT5O00445 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT5O00445 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT5O00445 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYT5O00445 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT5O00445 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT5O00445 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT5O00445 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYT5O00445 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT5O00445 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT5O00445 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT5O00445 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT5O00445 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT5O00445 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT5O00445 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT5O00445 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT5O00445 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT5O00445 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT5O00445 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT5O00445 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT5O00445 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYT5O00445 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYT5O00445 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT5O00445 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT5O00445 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT5O00445 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT5O00445 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT5O00445 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT5O00445 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT5O00445 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYT5O00445 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYT5O00445 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYT5O00445 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT5O00445 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT5O00445 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT5O00445 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT5O00445 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT5O00445 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT5O00445 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT5O00445 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYT5O00445 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms