Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms