Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN8O00124 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBXN8O00124 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBXN8O00124 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBXN8O00124 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms