Protein–RNA interactions for Protein: F8VWA3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VWA3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
F8VWA3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
F8VWA3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
F8VWA3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
F8VWA3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
F8VWA3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
F8VWA3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
F8VWA3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
F8VWA3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
F8VWA3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
F8VWA3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
F8VWA3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
F8VWA3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
F8VWA3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
F8VWA3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
F8VWA3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
F8VWA3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
F8VWA3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
F8VWA3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
F8VWA3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
F8VWA3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
F8VWA3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
F8VWA3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
F8VWA3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
F8VWA3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
F8VWA3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
F8VWA3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
F8VWA3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
F8VWA3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
F8VWA3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
F8VWA3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
F8VWA3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
F8VWA3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
F8VWA3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
F8VWA3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
F8VWA3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
F8VWA3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
F8VWA3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
F8VWA3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
F8VWA3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
F8VWA3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
F8VWA3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
F8VWA3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
F8VWA3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
F8VWA3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
F8VWA3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
F8VWA3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
F8VWA3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
F8VWA3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
F8VWA3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
F8VWA3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
F8VWA3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
F8VWA3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
F8VWA3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
F8VWA3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
F8VWA3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
F8VWA3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
F8VWA3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
F8VWA3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
F8VWA3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
F8VWA3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
F8VWA3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
F8VWA3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
F8VWA3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
F8VWA3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
F8VWA3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
F8VWA3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
F8VWA3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
F8VWA3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
F8VWA3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
F8VWA3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
F8VWA3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
F8VWA3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
F8VWA3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
F8VWA3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
F8VWA3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
F8VWA3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
F8VWA3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
F8VWA3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
F8VWA3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
F8VWA3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
F8VWA3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
F8VWA3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
F8VWA3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
F8VWA3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
F8VWA3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
F8VWA3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
F8VWA3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
F8VWA3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
F8VWA3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
F8VWA3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
F8VWA3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
F8VWA3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
F8VWA3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
F8VWA3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
F8VWA3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
F8VWA3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
F8VWA3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
F8VWA3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
F8VWA3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms