Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC182A6NF36 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC182A6NF36 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC182A6NF36 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC182A6NF36 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC182A6NF36 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC182A6NF36 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC182A6NF36 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC182A6NF36 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC182A6NF36 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC182A6NF36 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC182A6NF36 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC182A6NF36 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC182A6NF36 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC182A6NF36 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC182A6NF36 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC182A6NF36 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC182A6NF36 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC182A6NF36 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms