Protein–RNA interactions for Protein: Q96K30

RITA1, RBPJ-interacting and tubulin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RITA1Q96K30 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RITA1Q96K30 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms