RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411961.6

ANKRD54-204, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ANKRD54, Length 946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-204ENST00000411961 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.12■■■■■ 5.29
ANKRD54-204ENST00000411961 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.97■■■■■ 4.47
ANKRD54-204ENST00000411961 ABCC9O60706 1549 aa42.51■■■■■ 4.4
ANKRD54-204ENST00000411961 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.7■■■■■ 4.11
ANKRD54-204ENST00000411961 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.6■■■■■ 4.09
ANKRD54-204ENST00000411961 NACADO15069 1562 aa40.52■■■■■ 4.08
ANKRD54-204ENST00000411961 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.07■■■■■ 4.01
ANKRD54-204ENST00000411961 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
ANKRD54-204ENST00000411961 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.75■■■■□ 3.95
ANKRD54-204ENST00000411961 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.74■■■■□ 3.95
ANKRD54-204ENST00000411961 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.69■■■■□ 3.94
ANKRD54-204ENST00000411961 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.4■■■■□ 3.9
ANKRD54-204ENST00000411961 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.38■■■■□ 3.89
ANKRD54-204ENST00000411961 SCRIBQ14160 1630 aa39.22■■■■□ 3.87
ANKRD54-204ENST00000411961 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.96■■■■□ 3.83
ANKRD54-204ENST00000411961 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
ANKRD54-204ENST00000411961 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.41■■■■□ 3.74
ANKRD54-204ENST00000411961 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.24■■■■□ 3.71
ANKRD54-204ENST00000411961 SMARCA4P51532 1647 aa37.43■■■■□ 3.58
ANKRD54-204ENST00000411961 NCAPD3P42695 1498 aa37.38■■■■□ 3.57
ANKRD54-204ENST00000411961 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.35■■■■□ 3.57
ANKRD54-204ENST00000411961 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.33■■■■□ 3.57
ANKRD54-204ENST00000411961 SMARCA2P51531 1590 aa37.3■■■■□ 3.56
ANKRD54-204ENST00000411961 HMGXB3Q12766 1538 aa37.14■■■■□ 3.54
ANKRD54-204ENST00000411961 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.08■■■■□ 3.53
ANKRD54-204ENST00000411961 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
ANKRD54-204ENST00000411961 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.02■■■■□ 3.52
ANKRD54-204ENST00000411961 ERCC6Q03468 1493 aa36.73■■■■□ 3.47
ANKRD54-204ENST00000411961 WIZO95785 1651 aa36.68■■■■□ 3.46
ANKRD54-204ENST00000411961 NESP48681 1621 aa36.63■■■■□ 3.45
ANKRD54-204ENST00000411961 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
ANKRD54-204ENST00000411961 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.49■■■■□ 3.43
ANKRD54-204ENST00000411961 CUX2O14529 1486 aa36.43■■■■□ 3.42
ANKRD54-204ENST00000411961 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.3■■■■□ 3.4
ANKRD54-204ENST00000411961 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.29■■■■□ 3.4
ANKRD54-204ENST00000411961 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
ANKRD54-204ENST00000411961 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.2■■■■□ 3.39
ANKRD54-204ENST00000411961 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
ANKRD54-204ENST00000411961 CFTRP13569 1480 aa35.95■■■■□ 3.35
ANKRD54-204ENST00000411961 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.92■■■■□ 3.34
ANKRD54-204ENST00000411961 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.89■■■■□ 3.34
ANKRD54-204ENST00000411961 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.88■■■■□ 3.33
ANKRD54-204ENST00000411961 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.85■■■■□ 3.33
ANKRD54-204ENST00000411961 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.84■■■■□ 3.33
ANKRD54-204ENST00000411961 WDR62O43379 1518 aa35.77■■■■□ 3.32
ANKRD54-204ENST00000411961 PRDM2Q13029 1718 aa35.68■■■■□ 3.3
ANKRD54-204ENST00000411961 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
ANKRD54-204ENST00000411961 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
ANKRD54-204ENST00000411961 ABCC8Q09428 1581 aa35.27■■■■□ 3.24
ANKRD54-204ENST00000411961 TOPBP1Q92547 1522 aa35.25■■■■□ 3.23
ANKRD54-204ENST00000411961 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.17■■■■□ 3.22
ANKRD54-204ENST00000411961 IFT140Q96RY7 1462 aa35.15■■■■□ 3.22
ANKRD54-204ENST00000411961 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
ANKRD54-204ENST00000411961 OSCARQ8IYS5 282 aa34.93■■■■□ 3.18
ANKRD54-204ENST00000411961 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
ANKRD54-204ENST00000411961 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
ANKRD54-204ENST00000411961 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
ANKRD54-204ENST00000411961 SOGA1O94964 1423 aa34.82■■■■□ 3.17
ANKRD54-204ENST00000411961 CUX1P39880 1505 aa34.81■■■■□ 3.16
ANKRD54-204ENST00000411961 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.79■■■■□ 3.16
ANKRD54-204ENST00000411961 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.79■■■■□ 3.16
ANKRD54-204ENST00000411961 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.78■■■■□ 3.16
ANKRD54-204ENST00000411961 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
ANKRD54-204ENST00000411961 FBLN2P98095 1184 aa34.59■■■■□ 3.13
ANKRD54-204ENST00000411961 WDR97A6NE52 1622 aa34.59■■■■□ 3.13
ANKRD54-204ENST00000411961 TRIM41Q8WV44 630 aa34.58■■■■□ 3.13
ANKRD54-204ENST00000411961 CHD1O14646 1710 aa34.52■■■■□ 3.12
ANKRD54-204ENST00000411961 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.46■■■■□ 3.11
ANKRD54-204ENST00000411961 GRIN2BQ13224 1484 aa34.45■■■■□ 3.1
ANKRD54-204ENST00000411961 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.44■■■■□ 3.1
ANKRD54-204ENST00000411961 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.4■■■■□ 3.1
ANKRD54-204ENST00000411961 TOP2BQ02880 1626 aa34.4■■■■□ 3.1
ANKRD54-204ENST00000411961 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.4■■■■□ 3.1
ANKRD54-204ENST00000411961 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.39■■■■□ 3.1
ANKRD54-204ENST00000411961 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
ANKRD54-204ENST00000411961 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
ANKRD54-204ENST00000411961 SYNJ1O43426 1573 aa34.36■■■■□ 3.09
ANKRD54-204ENST00000411961 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.34■■■■□ 3.09
ANKRD54-204ENST00000411961 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.34■■■■□ 3.09
ANKRD54-204ENST00000411961 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.34■■■■□ 3.09
ANKRD54-204ENST00000411961 PBRM1Q86U86 1689 aa34.34■■■■□ 3.09
ANKRD54-204ENST00000411961 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.29■■■■□ 3.08
ANKRD54-204ENST00000411961 ARHGEF11O15085 1522 aa34.27■■■■□ 3.08
ANKRD54-204ENST00000411961 SYNJ2O15056 1496 aa34.25■■■■□ 3.07
ANKRD54-204ENST00000411961 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.08■■■■□ 3.05
ANKRD54-204ENST00000411961 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.08■■■■□ 3.05
ANKRD54-204ENST00000411961 ADAMTS12P58397 1594 aa34■■■■□ 3.03
ANKRD54-204ENST00000411961 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.99■■■■□ 3.03
ANKRD54-204ENST00000411961 GRIN2AQ12879 1464 aa33.98■■■■□ 3.03
ANKRD54-204ENST00000411961 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.97■■■■□ 3.03
ANKRD54-204ENST00000411961 ARAP1Q96P48 1450 aa33.95■■■■□ 3.02
ANKRD54-204ENST00000411961 CEP170Q5SW79 1584 aa33.81■■■■□ 3
ANKRD54-204ENST00000411961 NUP160Q12769 1436 aa33.8■■■■□ 3
ANKRD54-204ENST00000411961 KIF27Q86VH2 1401 aa33.8■■■■□ 3
ANKRD54-204ENST00000411961 IGF1RP08069 1367 aa33.68■■■□□ 2.98
ANKRD54-204ENST00000411961 CUL7Q14999 1698 aa33.62■■■□□ 2.97
ANKRD54-204ENST00000411961 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.61■■■□□ 2.97
ANKRD54-204ENST00000411961 SHROOM2Q13796 1616 aa33.61■■■□□ 2.97
ANKRD54-204ENST00000411961 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.59■■■□□ 2.97
ANKRD54-204ENST00000411961 JPH4Q96JJ6 628 aa33.56■■■□□ 2.96
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