RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517910.1

AP003356.1-202, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AP003356.1, Length 2,770 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP003356.1-202ENST00000517910 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.27■■■■□ 3.4
AP003356.1-202ENST00000517910 HRCP23327 699 aa33.09■■■□□ 2.89
AP003356.1-202ENST00000517910 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
AP003356.1-202ENST00000517910 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.36■■■□□ 2.77
AP003356.1-202ENST00000517910 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.36■■■□□ 2.77
AP003356.1-202ENST00000517910 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
AP003356.1-202ENST00000517910 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
AP003356.1-202ENST00000517910 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.08■■■□□ 2.73
AP003356.1-202ENST00000517910 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.87■■■□□ 2.69
AP003356.1-202ENST00000517910 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.45■■■□□ 2.63
AP003356.1-202ENST00000517910 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
AP003356.1-202ENST00000517910 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.6
AP003356.1-202ENST00000517910 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.17■■■□□ 2.58
AP003356.1-202ENST00000517910 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.09■■■□□ 2.57
AP003356.1-202ENST00000517910 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
AP003356.1-202ENST00000517910 MYT1Q01538 1121 aa30.99■■■□□ 2.55
AP003356.1-202ENST00000517910 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
AP003356.1-202ENST00000517910 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
AP003356.1-202ENST00000517910 NEUROD1Q13562 356 aa30.5■■■□□ 2.47
AP003356.1-202ENST00000517910 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa30.37■■■□□ 2.45
AP003356.1-202ENST00000517910 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.32■■■□□ 2.44
AP003356.1-202ENST00000517910 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
AP003356.1-202ENST00000517910 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
AP003356.1-202ENST00000517910 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
AP003356.1-202ENST00000517910 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
AP003356.1-202ENST00000517910 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
AP003356.1-202ENST00000517910 TRIM41Q8WV44 630 aa29.88■■■□□ 2.37
AP003356.1-202ENST00000517910 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.81■■■□□ 2.36
AP003356.1-202ENST00000517910 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
AP003356.1-202ENST00000517910 ABCC9O60706 1549 aa29.38■■■□□ 2.29
AP003356.1-202ENST00000517910 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
AP003356.1-202ENST00000517910 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
AP003356.1-202ENST00000517910 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.21■■■□□ 2.27
AP003356.1-202ENST00000517910 MIER1Q8N108 512 aa29.21■■■□□ 2.27
AP003356.1-202ENST00000517910 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
AP003356.1-202ENST00000517910 BCL11AQ9H165 835 aa28.98■■■□□ 2.23
AP003356.1-202ENST00000517910 ANP32EQ9BTT0 268 aa28.93■■■□□ 2.22
AP003356.1-202ENST00000517910 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
AP003356.1-202ENST00000517910 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.83■■■□□ 2.21
AP003356.1-202ENST00000517910 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.78■■■□□ 2.2
AP003356.1-202ENST00000517910 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.77■■■□□ 2.2
AP003356.1-202ENST00000517910 SCRIBQ14160 1630 aa28.72■■■□□ 2.19
AP003356.1-202ENST00000517910 CEP162Q5TB80 1403 aa28.65■■■□□ 2.18
AP003356.1-202ENST00000517910 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.62■■■□□ 2.17
AP003356.1-202ENST00000517910 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
AP003356.1-202ENST00000517910 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.44■■■□□ 2.14
AP003356.1-202ENST00000517910 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.4■■■□□ 2.14
AP003356.1-202ENST00000517910 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.38■■■□□ 2.13
AP003356.1-202ENST00000517910 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
AP003356.1-202ENST00000517910 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.31■■■□□ 2.12
AP003356.1-202ENST00000517910 WIZO95785 1651 aa28.3■■■□□ 2.12
AP003356.1-202ENST00000517910 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
AP003356.1-202ENST00000517910 BCANQ96GW7 911 aa28.25■■■□□ 2.11
AP003356.1-202ENST00000517910 SOGA1O94964 1423 aa28.24■■■□□ 2.11
AP003356.1-202ENST00000517910 ABCC8Q09428 1581 aa28.24■■■□□ 2.11
AP003356.1-202ENST00000517910 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
AP003356.1-202ENST00000517910 FKBP8Q14318 412 aa28.08■■■□□ 2.09
AP003356.1-202ENST00000517910 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
AP003356.1-202ENST00000517910 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.05■■■□□ 2.08
AP003356.1-202ENST00000517910 EEA1Q15075 1411 aa28.04■■■□□ 2.08
AP003356.1-202ENST00000517910 GOLGA3Q08378 1498 aa28.04■■■□□ 2.08
AP003356.1-202ENST00000517910 KCNH8Q96L42 1107 aa28.02■■■□□ 2.08
AP003356.1-202ENST00000517910 APLP2Q06481 763 aa27.96■■■□□ 2.07
AP003356.1-202ENST00000517910 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
AP003356.1-202ENST00000517910 CLIP1P30622 1438 aa27.86■■■□□ 2.05
AP003356.1-202ENST00000517910 NEFLP07196 543 aa27.85■■■□□ 2.05
AP003356.1-202ENST00000517910 MSH5O43196 834 aa27.84■■■□□ 2.05
AP003356.1-202ENST00000517910 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.84■■■□□ 2.05
AP003356.1-202ENST00000517910 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
AP003356.1-202ENST00000517910 NACADO15069 1562 aa27.82■■■□□ 2.04
AP003356.1-202ENST00000517910 ITGAEP38570 1179 aa27.82■■■□□ 2.04
AP003356.1-202ENST00000517910 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.72■■■□□ 2.03
AP003356.1-202ENST00000517910 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
AP003356.1-202ENST00000517910 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
AP003356.1-202ENST00000517910 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.67■■■□□ 2.02
AP003356.1-202ENST00000517910 SMARCA2P51531 1590 aa27.66■■■□□ 2.02
AP003356.1-202ENST00000517910 KIF21BO75037 1637 aa27.6■■■□□ 2.01
AP003356.1-202ENST00000517910 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
AP003356.1-202ENST00000517910 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.58■■■□□ 2.01
AP003356.1-202ENST00000517910 TRIM52Q96A61 297 aa27.58■■■□□ 2.01
AP003356.1-202ENST00000517910 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
AP003356.1-202ENST00000517910 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.99
AP003356.1-202ENST00000517910 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.44■■□□□ 1.98
AP003356.1-202ENST00000517910 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.44■■□□□ 1.98
AP003356.1-202ENST00000517910 DEKP35659 375 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
AP003356.1-202ENST00000517910 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
AP003356.1-202ENST00000517910 CCER2I3L3R5 266 aa27.37■■□□□ 1.97
AP003356.1-202ENST00000517910 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
AP003356.1-202ENST00000517910 SMARCA4P51532 1647 aa27.35■■□□□ 1.97
AP003356.1-202ENST00000517910 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
AP003356.1-202ENST00000517910 CUX2O14529 1486 aa27.34■■□□□ 1.97
AP003356.1-202ENST00000517910 ANP32CO43423 234 aa27.33■■□□□ 1.97
AP003356.1-202ENST00000517910 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
AP003356.1-202ENST00000517910 SYNJ1O43426 1573 aa27.29■■□□□ 1.96
AP003356.1-202ENST00000517910 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
AP003356.1-202ENST00000517910 WDR97A6NE52 1622 aa27.25■■□□□ 1.95
AP003356.1-202ENST00000517910 MAPKBP1O60336 1514 aa27.25■■□□□ 1.95
AP003356.1-202ENST00000517910 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.25■■□□□ 1.95
AP003356.1-202ENST00000517910 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.23■■□□□ 1.95
AP003356.1-202ENST00000517910 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms