Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 RASA3-202ENST00000542651 975 ntTSL 515.08■□□□□ 01e-7■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 COMT-211ENST00000493893 354 ntTSL 314.57□□□□□ -0.081e-6■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.081e-7■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.112e-10■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.181e-7■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 COMT-208ENST00000428707 724 ntTSL 313.77□□□□□ -0.211e-6■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 BRD9-213ENST00000495794 4865 ntTSL 213.41□□□□□ -0.261e-7■□□□□ 10.1
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PUM1Q14671 ARHGEF2-212ENST00000474428 742 ntTSL 312.58□□□□□ -0.41e-7■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.441e-7■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 ARHGEF2-203ENST00000361247 4149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.521e-7■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 ARHGEF2-202ENST00000313695 4080 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.641e-7■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 SRRM2-209ENST00000572278 711 ntTSL 29.17□□□□□ -0.942e-10■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 SRRM2-215ENST00000573498 994 ntTSL 37.91□□□□□ -1.142e-10■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 TAF1-217ENST00000483985 836 ntTSL 36.9□□□□□ -1.31e-7■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 BRD9-211ENST00000494422 449 ntTSL 36.25□□□□□ -1.411e-7■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 ARHGEF2-214ENST00000477754 883 ntTSL 55.74□□□□□ -1.491e-7■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 SON-207ENST00000436227 5269 ntAPPRIS P1 TSL 58.13□□□□□ -1.113e-11■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 SON-205ENST00000421541 1151 ntTSL 1 (best)6.45□□□□□ -1.383e-11■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.851e-11■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 NOL7-203ENST00000474485 920 ntTSL 310.35□□□□□ -0.751e-11■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 SMARCC1-205ENST00000483847 804 ntTSL 212.32□□□□□ -0.445e-7■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 MCM3AP-201ENST00000291688 6193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.51e-7■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 SF3B6-202ENST00000478050 720 ntTSL 24.87□□□□□ -1.635e-10■□□□□ 10.1
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PUM1Q14671 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.172e-9■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -02e-9■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.145e-7■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 GTF3A-203ENST00000435781 688 ntTSL 521.15■□□□□ 0.983e-8■□□□□ 10.1
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PUM1Q14671 GTF3A-205ENST00000466776 461 ntTSL 513.03□□□□□ -0.323e-8■□□□□ 10.1
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PUM1Q14671 HNRNPR-208ENST00000476451 814 ntTSL 46.62□□□□□ -1.354e-11■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-6■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.072e-6■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 MPP1-208ENST00000439370 2066 ntTSL 511.48□□□□□ -0.572e-6■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 CAPRIN1-205ENST00000528856 595 ntTSL 523.58■■□□□ 1.373e-9■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.083e-9■□□□□ 10.1
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PUM1Q14671 CAPRIN1-202ENST00000389645 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.583e-9■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 CAPRIN1-201ENST00000341394 4108 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.843e-9■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.043e-9■□□□□ 10.1
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PUM1Q14671 PRAME-207ENST00000420709 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.88□□□□□ -0.196e-12■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 PRAME-211ENST00000476336 589 ntTSL 213.84□□□□□ -0.196e-12■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 PRAME-204ENST00000403441 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.53□□□□□ -0.246e-12■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 PRAME-210ENST00000442481 581 ntTSL 312.92□□□□□ -0.346e-12■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 AP002990.1-201ENST00000526409 1954 ntTSL 516.24■□□□□ 0.191e-7■□□□□ 10.1
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PUM1Q14671 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.141e-7■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.341e-7■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 PPP1R12A-208ENST00000547330 2275 ntTSL 1 (best)13.76□□□□□ -0.213e-8■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 PDAP1-204ENST00000496335 302 ntTSL 314.94□□□□□ -0.021e-9■□□□□ 10.1
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PUM1Q14671 PPP1CC-207ENST00000551582 563 ntTSL 45.1□□□□□ -1.595e-11■□□□□ 10.1
PUM1Q14671 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.895e-15■□□□□ 10
PUM1Q14671 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.535e-15■□□□□ 10
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PUM1Q14671 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.115e-15■□□□□ 10
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PUM1Q14671 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.428e-14■□□□□ 10
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PUM1Q14671 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.321e-6■□□□□ 10
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PUM1Q14671 XRCC6-206ENST00000428575 2148 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.751e-6■□□□□ 10
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PUM1Q14671 XRCC6-205ENST00000405878 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.831e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 TRIM44-202ENST00000532066 637 ntTSL 47.41□□□□□ -1.221e-10■□□□□ 10
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PUM1Q14671 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.159e-56■□□□□ 10
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PUM1Q14671 RPLP2-206ENST00000530398 313 ntTSL 311.88□□□□□ -0.519e-56■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPS27-204ENST00000493224 573 ntTSL 218.35■□□□□ 0.533e-19■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPS27-203ENST00000477151 467 ntTSL 213.62□□□□□ -0.233e-19■□□□□ 10
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PUM1Q14671 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.173e-19■□□□□ 10
PUM1Q14671 MDH1-202ENST00000409476 808 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.71e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 MDH1-203ENST00000409908 700 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.71e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 MDH1-216ENST00000544381 1346 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.811e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 MDH1-201ENST00000233114 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.911e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 MDH1-215ENST00000539945 1443 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.971e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 ACTB-213ENST00000493945 1236 ntTSL 514.35□□□□□ -0.113e-35■□□□□ 10
PUM1Q14671 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.012e-10■□□□□ 10
PUM1Q14671 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.182e-10■□□□□ 10
PUM1Q14671 HNRNPR-202ENST00000374612 2694 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.612e-10■□□□□ 10
PUM1Q14671 HNRNPR-203ENST00000374616 2691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.612e-10■□□□□ 10
PUM1Q14671 HNRNPR-201ENST00000302271 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.652e-10■□□□□ 10
PUM1Q14671 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.152e-10■□□□□ 10
PUM1Q14671 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.61e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.751e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 ILF3-215ENST00000589485 620 ntTSL 221.27■■□□□ 11e-11■□□□□ 10
PUM1Q14671 ILF3-207ENST00000587840 655 ntTSL 517.23■□□□□ 0.351e-11■□□□□ 10
PUM1Q14671 ILF3-206ENST00000587505 791 ntTSL 516.75■□□□□ 0.271e-11■□□□□ 10
PUM1Q14671 ILF3-214ENST00000589416 773 ntTSL 415.27■□□□□ 0.041e-11■□□□□ 10
PUM1Q14671 ILF3-218ENST00000590009 953 ntTSL 513.58□□□□□ -0.241e-11■□□□□ 10
PUM1Q14671 ILF3-211ENST00000589052 637 ntTSL 59.39□□□□□ -0.911e-11■□□□□ 10
PUM1Q14671 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.421e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.391e-9■□□□□ 10
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