Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.372e-6■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.442e-6■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 FNDC3B-211ENST00000490832 772 ntTSL 49.29□□□□□ -0.922e-15■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.494e-6■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.424e-6■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 RUVBL2-204ENST00000594338 1853 ntTSL 523.53■■□□□ 1.364e-6■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 RUVBL2-208ENST00000596247 1563 ntTSL 222.73■■□□□ 1.234e-6■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 RUVBL2-201ENST00000221413 1478 ntTSL 1 (best)21.6■■□□□ 1.054e-6■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 RUVBL2-212ENST00000627972 1065 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.214e-6■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.011e-8■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 TNFRSF10B-207ENST00000523504 1464 ntTSL 226.79■■□□□ 1.881e-8■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 GORASP2-211ENST00000497928 711 ntTSL 525.63■■□□□ 1.691e-8■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.411e-8■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 TNFRSF10B-201ENST00000276431 4146 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.241e-8■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 KDM3B-202ENST00000504095 555 ntTSL 310.41□□□□□ -0.741e-8■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 TNFRSF10B-208ENST00000523752 3328 ntTSL 1 (best)9.55□□□□□ -0.881e-8■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 COASY-213ENST00000591753 2225 ntTSL 1 (best)20.46■□□□□ 0.873e-7■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.651e-323■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.651e-323■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.631e-323■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.31e-323■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.291e-323■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 SF3B2-204ENST00000525207 493 ntTSL 211.66□□□□□ -0.541e-6■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.711e-6■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 DEK-204ENST00000505224 1372 ntTSL 217.21■□□□□ 0.351e-6■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.311e-6■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.432e-7■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 TCAF1-202ENST00000392900 2513 ntTSL 215.35■□□□□ 0.052e-7■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 TCAF1-201ENST00000355951 3343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.752e-7■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 PRKAR1A-220ENST00000592194 556 ntTSL 216.74■□□□□ 0.273e-8■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 SLC25A3-209ENST00000548046 550 ntTSL 417.48■□□□□ 0.393e-8■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 SLC25A3-213ENST00000550695 756 ntTSL 316.98■□□□□ 0.313e-8■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.253e-8■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 SLC25A3-208ENST00000547908 893 ntTSL 27.4□□□□□ -1.223e-8■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 SART3-202ENST00000431469 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.221e-6■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 SART3-201ENST00000228284 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.491e-6■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 SART3-204ENST00000546728 3637 ntTSL 1 (best)10.09□□□□□ -0.791e-6■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 ACTN1-219ENST00000556432 558 ntTSL 1 (best)17.07■□□□□ 0.322e-12■□□□□ 10.4
G3BP1Q13283 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.618e-12■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 CYB5R3-206ENST00000438270 675 ntTSL 315.23■□□□□ 0.038e-12■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 KANK1-201ENST00000354485 6912 ntTSL 29.94□□□□□ -0.828e-7■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 RUVBL2-207ENST00000595811 572 ntTSL 527.26■■□□□ 1.953e-9■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.793e-9■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 YBX1-202ENST00000332220 776 ntTSL 525.97■■□□□ 1.753e-9■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.592e-6■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 GRSF1-202ENST00000499044 2491 ntTSL 221.05■□□□□ 0.963e-9■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.653e-9■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.363e-9■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 GRSF1-204ENST00000505068 3561 ntTSL 215.93■□□□□ 0.143e-9■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 DNM2-210ENST00000587830 868 ntTSL 513.89□□□□□ -0.192e-6■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 GRSF1-207ENST00000514161 1765 ntTSL 213.66□□□□□ -0.223e-9■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 GRSF1-203ENST00000502323 1794 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.513e-9■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 GRSF1-206ENST00000508091 419 ntTSL 311.87□□□□□ -0.513e-9■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 MCM4-214ENST00000523853 354 ntTSL 210.71□□□□□ -0.693e-9■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 GRSF1-205ENST00000506453 925 ntTSL 310.54□□□□□ -0.723e-9■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 PSMD1-206ENST00000444007 491 ntTSL 34.18□□□□□ -1.743e-9■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 TCP1-204ENST00000467544 658 ntTSL 23.66□□□□□ -1.823e-9■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.721e-7■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 SRC-210ENST00000493775 559 ntTSL 418.9■□□□□ 0.622e-9■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.382e-9■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.142e-9■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 SRC-203ENST00000373567 4321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.022e-9■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 SRC-207ENST00000477066 3300 ntTSL 214.42□□□□□ -0.12e-9■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 SRC-201ENST00000358208 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-9■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 TMEM214-205ENST00000434544 834 ntTSL 221.07■□□□□ 0.962e-6■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 PRPF8-211ENST00000574728 466 ntTSL 25.8□□□□□ -1.481e-7■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 TTR-205ENST00000613781 556 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.73e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 TTR-203ENST00000541025 956 ntTSL 27.74□□□□□ -1.173e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 TKFC-206ENST00000525366 916 ntTSL 223.19■■□□□ 1.37e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 PLEC-213ENST00000528025 2115 ntTSL 523.22■■□□□ 1.311e-6■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 NGDN-211ENST00000556699 725 ntTSL 27.09□□□□□ -1.274e-6■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 CTNNA1-213ENST00000519113 859 ntTSL 323.3■■□□□ 1.323e-10■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 CTNNA1-206ENST00000517980 696 ntTSL 421.4■■□□□ 1.023e-10■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 CTNNA1-234ENST00000522227 642 ntTSL 313.4□□□□□ -0.263e-10■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 CTNNA1-240ENST00000523912 545 ntTSL 410.95□□□□□ -0.663e-10■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 TCP1-207ENST00000536807 873 ntTSL 215.26■□□□□ 0.031e-6■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 MYDGF-202ENST00000596031 335 ntTSL 317.46■□□□□ 0.392e-6■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 ACSL4-212ENST00000514500 696 ntTSL 517.86■□□□□ 0.452e-9■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 CYFIP1-203ENST00000610365 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.511e-7■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.711e-7■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 CORO1C-207ENST00000547170 804 ntTSL 49.13□□□□□ -0.953e-7■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 ADAR-209ENST00000530954 558 ntTSL 211.58□□□□□ -0.565e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 FUBP1-201ENST00000294623 2201 ntTSL 1 (best)16.27■□□□□ 0.191e-7■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.051e-7■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.151e-7■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.34e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 CDK4-210ENST00000551888 636 ntTSL 221.77■■□□□ 1.084e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 CDK4-207ENST00000550419 919 ntTSL 321.65■■□□□ 1.064e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 CDK4-208ENST00000551706 984 ntTSL 1 (best)21.46■■□□□ 1.034e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 CDK4-209ENST00000551800 773 ntTSL 521.08■□□□□ 0.974e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.814e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 CDK4-204ENST00000547281 825 ntTSL 320.02■□□□□ 0.84e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 CDK4-215ENST00000553237 952 ntTSL 219.67■□□□□ 0.744e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.714e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 CDK4-203ENST00000546489 776 ntTSL 516.26■□□□□ 0.194e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 CDK4-212ENST00000552388 694 ntTSL 316.26■□□□□ 0.194e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 CDK4-214ENST00000552862 447 ntTSL 315.43■□□□□ 0.064e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 CDK4-211ENST00000552254 769 ntTSL 211.34□□□□□ -0.594e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 UBXN4-201ENST00000272638 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.046e-8■□□□□ 10.3
G3BP1Q13283 UBXN4-208ENST00000490163 3394 ntTSL 23.42□□□□□ -1.866e-8■□□□□ 10.3
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