Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF253O75346 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF253O75346 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF253O75346 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF253O75346 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF253O75346 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF253O75346 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF253O75346 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF253O75346 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF253O75346 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF253O75346 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF253O75346 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF253O75346 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF253O75346 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF253O75346 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF253O75346 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF253O75346 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF253O75346 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF253O75346 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF253O75346 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF253O75346 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF253O75346 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF253O75346 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF253O75346 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF253O75346 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF253O75346 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF253O75346 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF253O75346 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF253O75346 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF253O75346 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF253O75346 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF253O75346 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF253O75346 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF253O75346 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF253O75346 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF253O75346 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF253O75346 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF253O75346 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF253O75346 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF253O75346 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF253O75346 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF253O75346 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF253O75346 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF253O75346 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF253O75346 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms