RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446745.2

LTB-211, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 853 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-211ENST00000446745 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.72■■■■■ 5.87
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LTB-211ENST00000446745 ABCC9O60706 1549 aa45.6■■■■■ 4.89
LTB-211ENST00000446745 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.76■■■■■ 4.6
LTB-211ENST00000446745 NACADO15069 1562 aa43.59■■■■■ 4.57
LTB-211ENST00000446745 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.43■■■■■ 4.54
LTB-211ENST00000446745 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.17■■■■■ 4.5
LTB-211ENST00000446745 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.98■■■■■ 4.47
LTB-211ENST00000446745 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.81■■■■■ 4.44
LTB-211ENST00000446745 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.68■■■■■ 4.42
LTB-211ENST00000446745 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.5■■■■■ 4.39
LTB-211ENST00000446745 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.32■■■■■ 4.37
LTB-211ENST00000446745 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.13■■■■■ 4.33
LTB-211ENST00000446745 SCRIBQ14160 1630 aa42.1■■■■■ 4.33
LTB-211ENST00000446745 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42■■■■■ 4.31
LTB-211ENST00000446745 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
LTB-211ENST00000446745 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.24■■■■■ 4.19
LTB-211ENST00000446745 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.06■■■■■ 4.16
LTB-211ENST00000446745 SMARCA4P51532 1647 aa40.24■■■■■ 4.03
LTB-211ENST00000446745 NCAPD3P42695 1498 aa40.17■■■■■ 4.02
LTB-211ENST00000446745 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
LTB-211ENST00000446745 SMARCA2P51531 1590 aa40.13■■■■■ 4.01
LTB-211ENST00000446745 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.11■■■■■ 4.01
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LTB-211ENST00000446745 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
LTB-211ENST00000446745 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.8■■■■□ 3.96
LTB-211ENST00000446745 ERCC6Q03468 1493 aa39.43■■■■□ 3.9
LTB-211ENST00000446745 WIZO95785 1651 aa39.38■■■■□ 3.89
LTB-211ENST00000446745 NESP48681 1621 aa39.29■■■■□ 3.88
LTB-211ENST00000446745 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.24■■■■□ 3.87
LTB-211ENST00000446745 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.2■■■■□ 3.87
LTB-211ENST00000446745 CUX2O14529 1486 aa39.17■■■■□ 3.86
LTB-211ENST00000446745 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.01■■■■□ 3.84
LTB-211ENST00000446745 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.99■■■■□ 3.83
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LTB-211ENST00000446745 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.87■■■■□ 3.81
LTB-211ENST00000446745 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.83■■■■□ 3.81
LTB-211ENST00000446745 CFTRP13569 1480 aa38.65■■■■□ 3.78
LTB-211ENST00000446745 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.6■■■■□ 3.77
LTB-211ENST00000446745 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.58■■■■□ 3.77
LTB-211ENST00000446745 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.55■■■■□ 3.76
LTB-211ENST00000446745 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.47■■■■□ 3.75
LTB-211ENST00000446745 WDR62O43379 1518 aa38.47■■■■□ 3.75
LTB-211ENST00000446745 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.42■■■■□ 3.74
LTB-211ENST00000446745 PRDM2Q13029 1718 aa38.4■■■■□ 3.74
LTB-211ENST00000446745 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.14■■■■□ 3.7
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LTB-211ENST00000446745 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
LTB-211ENST00000446745 TOPBP1Q92547 1522 aa37.87■■■■□ 3.65
LTB-211ENST00000446745 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.82■■■■□ 3.65
LTB-211ENST00000446745 IFT140Q96RY7 1462 aa37.79■■■■□ 3.64
LTB-211ENST00000446745 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.56■■■■□ 3.6
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LTB-211ENST00000446745 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
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LTB-211ENST00000446745 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.36■■■■□ 3.57
LTB-211ENST00000446745 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.32■■■■□ 3.56
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LTB-211ENST00000446745 CHD1O14646 1710 aa37.07■■■■□ 3.53
LTB-211ENST00000446745 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.03■■■■□ 3.52
LTB-211ENST00000446745 FBLN2P98095 1184 aa37.03■■■■□ 3.52
LTB-211ENST00000446745 GRIN2BQ13224 1484 aa37.01■■■■□ 3.52
LTB-211ENST00000446745 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37■■■■□ 3.51
LTB-211ENST00000446745 TOP2BQ02880 1626 aa36.99■■■■□ 3.51
LTB-211ENST00000446745 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.99■■■■□ 3.51
LTB-211ENST00000446745 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.99■■■■□ 3.51
LTB-211ENST00000446745 TRIM41Q8WV44 630 aa36.98■■■■□ 3.51
LTB-211ENST00000446745 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
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LTB-211ENST00000446745 PBRM1Q86U86 1689 aa36.9■■■■□ 3.5
LTB-211ENST00000446745 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.88■■■■□ 3.49
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LTB-211ENST00000446745 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.86■■■■□ 3.49
LTB-211ENST00000446745 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.86■■■■□ 3.49
LTB-211ENST00000446745 SYNJ2O15056 1496 aa36.82■■■■□ 3.49
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LTB-211ENST00000446745 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.57■■■■□ 3.44
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LTB-211ENST00000446745 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.5■■■■□ 3.43
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LTB-211ENST00000446745 CEP170Q5SW79 1584 aa36.32■■■■□ 3.4
LTB-211ENST00000446745 CUL7Q14999 1698 aa36.19■■■■□ 3.38
LTB-211ENST00000446745 IGF1RP08069 1367 aa36.15■■■■□ 3.38
LTB-211ENST00000446745 SHROOM2Q13796 1616 aa36.13■■■■□ 3.37
LTB-211ENST00000446745 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.03■■■■□ 3.36
LTB-211ENST00000446745 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.02■■■■□ 3.36
LTB-211ENST00000446745 JPH4Q96JJ6 628 aa35.99■■■■□ 3.35
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