RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619998.1

GGTLC3-201, Transcript of gamma-glutamyltransferase light chain family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene GGTLC3, Length 968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3-201ENST00000619998 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.63■■■■■ 5.7
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GGTLC3-201ENST00000619998 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.48■■■■■ 4.39
GGTLC3-201ENST00000619998 NACADO15069 1562 aa42.43■■■■■ 4.38
GGTLC3-201ENST00000619998 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.33■■■■■ 4.37
GGTLC3-201ENST00000619998 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.2■■■■■ 4.35
GGTLC3-201ENST00000619998 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
GGTLC3-201ENST00000619998 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.95■■■■■ 4.31
GGTLC3-201ENST00000619998 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.38■■■■■ 4.22
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GGTLC3-201ENST00000619998 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.16■■■■■ 4.18
GGTLC3-201ENST00000619998 SCRIBQ14160 1630 aa41.02■■■■■ 4.16
GGTLC3-201ENST00000619998 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.83■■■■■ 4.13
GGTLC3-201ENST00000619998 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.66■■■■■ 4.1
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GGTLC3-201ENST00000619998 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.94■■■■□ 3.98
GGTLC3-201ENST00000619998 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.73■■■■□ 3.95
GGTLC3-201ENST00000619998 SMARCA4P51532 1647 aa39.27■■■■□ 3.88
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GGTLC3-201ENST00000619998 NCAPD3P42695 1498 aa39.17■■■■□ 3.86
GGTLC3-201ENST00000619998 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.14■■■■□ 3.86
GGTLC3-201ENST00000619998 SMARCA2P51531 1590 aa39.09■■■■□ 3.85
GGTLC3-201ENST00000619998 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.98■■■■□ 3.83
GGTLC3-201ENST00000619998 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.95■■■■□ 3.83
GGTLC3-201ENST00000619998 HMGXB3Q12766 1538 aa38.94■■■■□ 3.82
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GGTLC3-201ENST00000619998 NESP48681 1621 aa38.16■■■■□ 3.7
GGTLC3-201ENST00000619998 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.12■■■■□ 3.69
GGTLC3-201ENST00000619998 ERCC6Q03468 1493 aa38.09■■■■□ 3.69
GGTLC3-201ENST00000619998 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.03■■■■□ 3.68
GGTLC3-201ENST00000619998 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.91■■■■□ 3.66
GGTLC3-201ENST00000619998 CUX2O14529 1486 aa37.78■■■■□ 3.64
GGTLC3-201ENST00000619998 CFTRP13569 1480 aa37.76■■■■□ 3.63
GGTLC3-201ENST00000619998 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.72■■■■□ 3.63
GGTLC3-201ENST00000619998 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.66■■■■□ 3.62
GGTLC3-201ENST00000619998 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
GGTLC3-201ENST00000619998 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.54■■■■□ 3.6
GGTLC3-201ENST00000619998 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.51■■■■□ 3.59
GGTLC3-201ENST00000619998 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.48■■■■□ 3.59
GGTLC3-201ENST00000619998 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
GGTLC3-201ENST00000619998 PRDM2Q13029 1718 aa37.35■■■■□ 3.57
GGTLC3-201ENST00000619998 WDR62O43379 1518 aa37.35■■■■□ 3.57
GGTLC3-201ENST00000619998 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
GGTLC3-201ENST00000619998 ABCC8Q09428 1581 aa37■■■■□ 3.51
GGTLC3-201ENST00000619998 TOPBP1Q92547 1522 aa36.92■■■■□ 3.5
GGTLC3-201ENST00000619998 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.87■■■■□ 3.49
GGTLC3-201ENST00000619998 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.79■■■■□ 3.48
GGTLC3-201ENST00000619998 IFT140Q96RY7 1462 aa36.75■■■■□ 3.47
GGTLC3-201ENST00000619998 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
GGTLC3-201ENST00000619998 CUX1P39880 1505 aa36.58■■■■□ 3.45
GGTLC3-201ENST00000619998 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
GGTLC3-201ENST00000619998 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.43
GGTLC3-201ENST00000619998 SOGA1O94964 1423 aa36.48■■■■□ 3.43
GGTLC3-201ENST00000619998 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.48■■■■□ 3.43
GGTLC3-201ENST00000619998 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.42■■■■□ 3.42
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GGTLC3-201ENST00000619998 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.33■■■■□ 3.41
GGTLC3-201ENST00000619998 WDR97A6NE52 1622 aa36.28■■■■□ 3.4
GGTLC3-201ENST00000619998 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.39
GGTLC3-201ENST00000619998 TOP2BQ02880 1626 aa36.25■■■■□ 3.39
GGTLC3-201ENST00000619998 OSCARQ8IYS5 282 aa36.23■■■■□ 3.39
GGTLC3-201ENST00000619998 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.22■■■■□ 3.39
GGTLC3-201ENST00000619998 SYNJ1O43426 1573 aa36.19■■■■□ 3.38
GGTLC3-201ENST00000619998 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.16■■■■□ 3.38
GGTLC3-201ENST00000619998 GRIN2BQ13224 1484 aa36.06■■■■□ 3.36
GGTLC3-201ENST00000619998 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.05■■■■□ 3.36
GGTLC3-201ENST00000619998 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
GGTLC3-201ENST00000619998 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.99■■■■□ 3.35
GGTLC3-201ENST00000619998 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.97■■■■□ 3.35
GGTLC3-201ENST00000619998 FBLN2P98095 1184 aa35.93■■■■□ 3.34
GGTLC3-201ENST00000619998 CHD1O14646 1710 aa35.88■■■■□ 3.34
GGTLC3-201ENST00000619998 PBRM1Q86U86 1689 aa35.88■■■■□ 3.33
GGTLC3-201ENST00000619998 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
GGTLC3-201ENST00000619998 SYNJ2O15056 1496 aa35.84■■■■□ 3.33
GGTLC3-201ENST00000619998 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.73■■■■□ 3.31
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GGTLC3-201ENST00000619998 ADAMTS12P58397 1594 aa35.64■■■■□ 3.3
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GGTLC3-201ENST00000619998 GRIN2AQ12879 1464 aa35.59■■■■□ 3.29
GGTLC3-201ENST00000619998 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.57■■■■□ 3.29
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GGTLC3-201ENST00000619998 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.54■■■■□ 3.28
GGTLC3-201ENST00000619998 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.54■■■■□ 3.28
GGTLC3-201ENST00000619998 IGF1RP08069 1367 aa35.5■■■■□ 3.27
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GGTLC3-201ENST00000619998 NUP160Q12769 1436 aa35.45■■■■□ 3.27
GGTLC3-201ENST00000619998 CEP170Q5SW79 1584 aa35.36■■■■□ 3.25
GGTLC3-201ENST00000619998 CUL7Q14999 1698 aa35.34■■■■□ 3.25
GGTLC3-201ENST00000619998 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.27■■■■□ 3.24
GGTLC3-201ENST00000619998 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.27■■■■□ 3.24
GGTLC3-201ENST00000619998 ARAP1Q96P48 1450 aa35.26■■■■□ 3.23
GGTLC3-201ENST00000619998 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.16■■■■□ 3.22
GGTLC3-201ENST00000619998 SHROOM2Q13796 1616 aa35.15■■■■□ 3.22
GGTLC3-201ENST00000619998 JPH4Q96JJ6 628 aa35.12■■■■□ 3.21
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