RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555927.5

SLC25A29-212, Transcript of solute carrier family 25 member 29, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SLC25A29, Length 960 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A29-212ENST00000555927 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.96■■■■■ 5.91
SLC25A29-212ENST00000555927 ABCC9O60706 1549 aa46.77■■■■■ 5.08
SLC25A29-212ENST00000555927 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.72■■■■■ 5.07
SLC25A29-212ENST00000555927 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.54■■■■■ 4.72
SLC25A29-212ENST00000555927 NACADO15069 1562 aa44.21■■■■■ 4.67
SLC25A29-212ENST00000555927 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.93■■■■■ 4.62
SLC25A29-212ENST00000555927 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.86■■■■■ 4.61
SLC25A29-212ENST00000555927 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.57■■■■■ 4.56
SLC25A29-212ENST00000555927 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.5■■■■■ 4.55
SLC25A29-212ENST00000555927 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.39■■■■■ 4.54
SLC25A29-212ENST00000555927 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.13■■■■■ 4.5
SLC25A29-212ENST00000555927 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.05■■■■■ 4.48
SLC25A29-212ENST00000555927 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.96■■■■■ 4.47
SLC25A29-212ENST00000555927 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.72■■■■■ 4.43
SLC25A29-212ENST00000555927 SCRIBQ14160 1630 aa42.52■■■■■ 4.4
SLC25A29-212ENST00000555927 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.24■■■■■ 4.35
SLC25A29-212ENST00000555927 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.18■■■■■ 4.34
SLC25A29-212ENST00000555927 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
SLC25A29-212ENST00000555927 NCAPD3P42695 1498 aa40.78■■■■■ 4.12
SLC25A29-212ENST00000555927 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.62■■■■■ 4.09
SLC25A29-212ENST00000555927 SMARCA2P51531 1590 aa40.57■■■■■ 4.09
SLC25A29-212ENST00000555927 SMARCA4P51532 1647 aa40.56■■■■■ 4.08
SLC25A29-212ENST00000555927 HMGXB3Q12766 1538 aa40.5■■■■■ 4.07
SLC25A29-212ENST00000555927 ERCC6Q03468 1493 aa40.49■■■■■ 4.07
SLC25A29-212ENST00000555927 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.47■■■■■ 4.07
SLC25A29-212ENST00000555927 CUX2O14529 1486 aa40.43■■■■■ 4.06
SLC25A29-212ENST00000555927 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
SLC25A29-212ENST00000555927 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
SLC25A29-212ENST00000555927 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.18■■■■■ 4.02
SLC25A29-212ENST00000555927 NESP48681 1621 aa40.11■■■■■ 4.01
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SLC25A29-212ENST00000555927 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.6■■■■□ 3.93
SLC25A29-212ENST00000555927 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.55■■■■□ 3.92
SLC25A29-212ENST00000555927 WIZO95785 1651 aa39.51■■■■□ 3.91
SLC25A29-212ENST00000555927 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.35■■■■□ 3.89
SLC25A29-212ENST00000555927 WDR62O43379 1518 aa39.23■■■■□ 3.87
SLC25A29-212ENST00000555927 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.18■■■■□ 3.86
SLC25A29-212ENST00000555927 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.15■■■■□ 3.86
SLC25A29-212ENST00000555927 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.1■■■■□ 3.85
SLC25A29-212ENST00000555927 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.84
SLC25A29-212ENST00000555927 CFTRP13569 1480 aa39.06■■■■□ 3.84
SLC25A29-212ENST00000555927 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.73■■■■□ 3.79
SLC25A29-212ENST00000555927 TRIM41Q8WV44 630 aa38.67■■■■□ 3.78
SLC25A29-212ENST00000555927 PRDM2Q13029 1718 aa38.66■■■■□ 3.78
SLC25A29-212ENST00000555927 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.59■■■■□ 3.77
SLC25A29-212ENST00000555927 OSCARQ8IYS5 282 aa38.56■■■■□ 3.76
SLC25A29-212ENST00000555927 IFT140Q96RY7 1462 aa38.41■■■■□ 3.74
SLC25A29-212ENST00000555927 TOPBP1Q92547 1522 aa38.33■■■■□ 3.73
SLC25A29-212ENST00000555927 ABCC8Q09428 1581 aa38.32■■■■□ 3.73
SLC25A29-212ENST00000555927 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.27■■■■□ 3.72
SLC25A29-212ENST00000555927 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.2■■■■□ 3.71
SLC25A29-212ENST00000555927 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.1■■■■□ 3.69
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SLC25A29-212ENST00000555927 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.01■■■■□ 3.67
SLC25A29-212ENST00000555927 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.01■■■■□ 3.67
SLC25A29-212ENST00000555927 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.97■■■■□ 3.67
SLC25A29-212ENST00000555927 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.93■■■■□ 3.66
SLC25A29-212ENST00000555927 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.92■■■■□ 3.662e-6■■■□□ 15.2
SLC25A29-212ENST00000555927 ARHGEF11O15085 1522 aa37.91■■■■□ 3.66
SLC25A29-212ENST00000555927 CHD1O14646 1710 aa37.8■■■■□ 3.64
SLC25A29-212ENST00000555927 SOGA1O94964 1423 aa37.78■■■■□ 3.64
SLC25A29-212ENST00000555927 FBLN2P98095 1184 aa37.76■■■■□ 3.64
SLC25A29-212ENST00000555927 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.76■■■■□ 3.63
SLC25A29-212ENST00000555927 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
SLC25A29-212ENST00000555927 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.68■■■■□ 3.62
SLC25A29-212ENST00000555927 WDR97A6NE52 1622 aa37.68■■■■□ 3.62
SLC25A29-212ENST00000555927 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.63■■■■□ 3.61
SLC25A29-212ENST00000555927 CUX1P39880 1505 aa37.6■■■■□ 3.61
SLC25A29-212ENST00000555927 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.57■■■■□ 3.6
SLC25A29-212ENST00000555927 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.54■■■■□ 3.6
SLC25A29-212ENST00000555927 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.59
SLC25A29-212ENST00000555927 ARAP1Q96P48 1450 aa37.5■■■■□ 3.59
SLC25A29-212ENST00000555927 GRIN2BQ13224 1484 aa37.49■■■■□ 3.59
SLC25A29-212ENST00000555927 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.48■■■■□ 3.59
SLC25A29-212ENST00000555927 SYNJ1O43426 1573 aa37.42■■■■□ 3.58
SLC25A29-212ENST00000555927 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.38■■■■□ 3.57
SLC25A29-212ENST00000555927 SYNJ2O15056 1496 aa37.38■■■■□ 3.57
SLC25A29-212ENST00000555927 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.33■■■■□ 3.57
SLC25A29-212ENST00000555927 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
SLC25A29-212ENST00000555927 PBRM1Q86U86 1689 aa37.28■■■■□ 3.56
SLC25A29-212ENST00000555927 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.26■■■■□ 3.56
SLC25A29-212ENST00000555927 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.19■■■■□ 3.54
SLC25A29-212ENST00000555927 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.14■■■■□ 3.54
SLC25A29-212ENST00000555927 TOP2BQ02880 1626 aa37.01■■■■□ 3.52
SLC25A29-212ENST00000555927 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.99■■■■□ 3.51
SLC25A29-212ENST00000555927 GRIN2AQ12879 1464 aa36.99■■■■□ 3.51
SLC25A29-212ENST00000555927 ADAMTS12P58397 1594 aa36.94■■■■□ 3.5
SLC25A29-212ENST00000555927 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.86■■■■□ 3.49
SLC25A29-212ENST00000555927 NUP160Q12769 1436 aa36.85■■■■□ 3.49
SLC25A29-212ENST00000555927 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.81■■■■□ 3.48
SLC25A29-212ENST00000555927 CEP170Q5SW79 1584 aa36.81■■■■□ 3.48
SLC25A29-212ENST00000555927 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.73■■■■□ 3.47
SLC25A29-212ENST00000555927 SHROOM2Q13796 1616 aa36.68■■■■□ 3.46
SLC25A29-212ENST00000555927 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
SLC25A29-212ENST00000555927 JPH4Q96JJ6 628 aa36.47■■■■□ 3.43
SLC25A29-212ENST00000555927 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.42■■■■□ 3.42
SLC25A29-212ENST00000555927 KIF27Q86VH2 1401 aa36.34■■■■□ 3.41
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