Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 FXYD1-210ENST00000592818 959 ntTSL 518.49■□□□□ 0.553e-13■■■■■ 52.3
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TBRG4Q969Z0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.23e-13■■■■■ 52.3
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TBRG4Q969Z0 FAM192A-202ENST00000389447 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.84e-8■■■■■ 52.3
TBRG4Q969Z0 SECISBP2-208ENST00000498819 854 ntTSL 59.34□□□□□ -0.914e-8■■■■■ 52.3
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TBRG4Q969Z0 PDE4D-208ENST00000502484 2478 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 52.3
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TBRG4Q969Z0 SFXN5-201ENST00000272433 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.587e-8■■■■■ 52
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TBRG4Q969Z0 SMYD3-202ENST00000366517 1372 ntTSL 1 (best)7.18□□□□□ -1.262e-6■■■■■ 52
TBRG4Q969Z0 SMYD3-217ENST00000493441 823 ntTSL 26.09□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 52
TBRG4Q969Z0 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.727e-7■■■■■ 52
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TBRG4Q969Z0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 51.6
TBRG4Q969Z0 ARID1B-205ENST00000414678 6528 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.53□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 51.6
TBRG4Q969Z0 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.184e-12■■■■■ 51.6
TBRG4Q969Z0 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.214e-12■■■■■ 51.6
TBRG4Q969Z0 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.394e-12■■■■■ 51.6
TBRG4Q969Z0 TMC8-202ENST00000589691 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.74e-12■■■■■ 51.6
TBRG4Q969Z0 GGA2-214ENST00000569182 587 ntTSL 49.96□□□□□ -0.824e-12■■■■■ 51.6
TBRG4Q969Z0 CUL3-215ENST00000546102 557 ntTSL 43.22□□□□□ -1.893e-8■■■■■ 51.6
TBRG4Q969Z0 CUL3-205ENST00000432260 587 ntTSL 32.38□□□□□ -2.033e-8■■■■■ 51.6
TBRG4Q969Z0 CUL3-206ENST00000436172 576 ntTSL 41.16□□□□□ -2.223e-8■■■■■ 51.6
TBRG4Q969Z0 RUNX1-216ENST00000482318 1710 ntTSL 1 (best)22.07■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 ENOX2-205ENST00000432489 1515 ntTSL 1 (best)21.56■■□□□ 1.043e-6■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 ENOX2-206ENST00000492263 819 ntTSL 320.96■□□□□ 0.953e-6■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.63e-6■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 STK24-207ENST00000491878 547 ntTSL 414.57□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 51.5
TBRG4Q969Z0 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 51.5
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