Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL35P42766 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL35P42766 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL35P42766 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL35P42766 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL35P42766 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL35P42766 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL35P42766 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL35P42766 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL35P42766 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL35P42766 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL35P42766 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL35P42766 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL35P42766 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL35P42766 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL35P42766 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL35P42766 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL35P42766 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL35P42766 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL35P42766 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL35P42766 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL35P42766 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL35P42766 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms