Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 MKS1-211ENST00000581761 812 ntTSL 312.7□□□□□ -0.388e-14■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 ALKBH3-207ENST00000530803 1557 ntTSL 212.67□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 TBCE-205ENST00000472011 1840 ntTSL 212.5□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 DEAF1-203ENST00000525626 585 ntTSL 312.3□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 CYTH1-212ENST00000590300 568 ntTSL 412.29□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.465e-9■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 TBL2-213ENST00000459913 2358 ntTSL 512.04□□□□□ -0.481e-9■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 ST3GAL5-207ENST00000461199 803 ntTSL 512□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 TTYH3-203ENST00000403167 4263 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.499e-9■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 LTBR-208ENST00000541005 583 ntTSL 211.89□□□□□ -0.512e-10■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 SLC40A1-202ENST00000418714 712 ntTSL 311.84□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 TMEM168-203ENST00000441474 570 ntTSL 411.8□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 GRN-217ENST00000590984 562 ntTSL 211.78□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 RFX1-207ENST00000589937 540 ntTSL 411.42□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 ADK-204ENST00000478611 443 ntTSL 311.4□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 MKS1-206ENST00000577824 1158 ntTSL 511.39□□□□□ -0.598e-14■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 ST3GAL5-254ENST00000640322 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 LZTR1-218ENST00000498649 1044 ntTSL 311.31□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 RALGDS-209ENST00000471109 636 ntTSL 311.26□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 OS9-221ENST00000552423 609 ntTSL 311.06□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 OS9-219ENST00000551285 583 ntTSL 311.06□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 OS9-223ENST00000553208 1022 ntTSL 311.06□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 LAMTOR2-203ENST00000368305 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 32.9
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SF3B4Q15427 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 GRN-202ENST00000585348 600 ntTSL 210.76□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 32.9
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SF3B4Q15427 USP3-214ENST00000559718 757 ntTSL 210.57□□□□□ -0.722e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 ST3GAL5-252ENST00000640314 2129 ntTSL 510.53□□□□□ -0.722e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 ST3GAL5-267ENST00000640903 2405 ntTSL 510.52□□□□□ -0.732e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 RFX1-204ENST00000588885 886 ntTSL 310.46□□□□□ -0.732e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 SLC40A1-206ENST00000455320 592 ntTSL 310.36□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 32.9
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SF3B4Q15427 ST3GAL5-250ENST00000640222 2356 ntTSL 510.23□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 PRUNE1-201ENST00000271620 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 32.9
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SF3B4Q15427 USP3-218ENST00000560202 1681 ntTSL 59.91□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 GRN-216ENST00000589923 437 ntTSL 29.84□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 ST3GAL5-257ENST00000640418 2467 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.852e-7■■■■■ 32.9
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SF3B4Q15427 LAMTOR2-201ENST00000368302 587 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 NUP188-204ENST00000467044 584 ntTSL 29.6□□□□□ -0.873e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 PRUNE1-206ENST00000431193 845 ntTSL 29.57□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 LAMTOR2-202ENST00000368304 521 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 CAPN1-225ENST00000533704 643 ntTSL 39.5□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 PRUNE1-203ENST00000368935 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 TDP1-211ENST00000555178 2200 ntTSL 59.41□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 32.9
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SF3B4Q15427 PRUNE1-207ENST00000450884 825 ntTSL 59.33□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 32.9
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SF3B4Q15427 WDFY2-201ENST00000298125 9321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 TDP1-201ENST00000335725 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 TTF2-204ENST00000469638 775 ntTSL 29.11□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 32.9
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SF3B4Q15427 TDP1-202ENST00000393452 2370 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 RPAP1-211ENST00000568413 586 ntTSL 38.05□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 ALKBH3-209ENST00000532410 648 ntTSL 58.01□□□□□ -1.132e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 TDP1-210ENST00000554976 3040 ntTSL 28.01□□□□□ -1.132e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 LCP1-203ENST00000416500 819 ntTSL 37.99□□□□□ -1.132e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 HSD17B4-220ENST00000513628 2225 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 KIDINS220-204ENST00000471275 598 ntTSL 37.92□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 THUMPD2-207ENST00000530095 662 ntTSL 37.56□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 LCP1-207ENST00000494531 537 ntTSL 37.56□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 TDP1-203ENST00000393454 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 RBM5-216ENST00000474470 434 ntTSL 37.53□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 HSD17B4-212ENST00000509514 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.222e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 ALKBH3-206ENST00000530754 582 ntTSL 57.37□□□□□ -1.232e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 ST3GAL5-205ENST00000433665 544 ntTSL 57.34□□□□□ -1.232e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 ALKBH3-204ENST00000529366 747 ntTSL 57.2□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 GTF3A-206ENST00000470606 1919 ntTSL 27.19□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 RBM5-218ENST00000475128 1371 ntTSL 27.19□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 VIRMA-205ENST00000521080 6472 ntTSL 1 (best)7.14□□□□□ -1.272e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 KIDINS220-202ENST00000319688 3765 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.32e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 TDP1-214ENST00000556063 1076 ntTSL 1 (best)6.93□□□□□ -1.32e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 ST3GAL5-243ENST00000639690 1201 ntTSL 56.85□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.362e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 VIRMA-207ENST00000522263 3219 ntTSL 1 (best)6.46□□□□□ -1.382e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 HSD17B4-218ENST00000512644 307 ntTSL 36.44□□□□□ -1.382e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 ST3GAL5-216ENST00000638258 455 ntTSL 36.4□□□□□ -1.382e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 32.9
SF3B4Q15427 PAIP1-207ENST00000511321 706 ntTSL 56.33□□□□□ -1.42e-7■■■■■ 32.9
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