RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262498.7

CFAP20-201, Transcript of cilia and flagella associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CFAP20, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20-201ENST00000262498 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.83■■■□□ 2.53
CFAP20-201ENST00000262498 ABCC9O60706 1549 aa28.44■■■□□ 2.14
CFAP20-201ENST00000262498 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.94■■■□□ 2.06
CFAP20-201ENST00000262498 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.27■■□□□ 1.96
CFAP20-201ENST00000262498 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.81■■□□□ 1.88
CFAP20-201ENST00000262498 NACADO15069 1562 aa26.5■■□□□ 1.83
CFAP20-201ENST00000262498 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.37■■□□□ 1.81
CFAP20-201ENST00000262498 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.35■■□□□ 1.81
CFAP20-201ENST00000262498 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.18■■□□□ 1.78
CFAP20-201ENST00000262498 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.07■■□□□ 1.76
CFAP20-201ENST00000262498 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.98■■□□□ 1.75
CFAP20-201ENST00000262498 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.7■■□□□ 1.71
CFAP20-201ENST00000262498 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.67■■□□□ 1.7
CFAP20-201ENST00000262498 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.64■■□□□ 1.7
CFAP20-201ENST00000262498 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CFAP20-201ENST00000262498 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
CFAP20-201ENST00000262498 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.44■■□□□ 1.66
CFAP20-201ENST00000262498 SCRIBQ14160 1630 aa25.38■■□□□ 1.65
CFAP20-201ENST00000262498 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.38■■□□□ 1.65
CFAP20-201ENST00000262498 CUX2O14529 1486 aa24.73■■□□□ 1.55
CFAP20-201ENST00000262498 ERCC6Q03468 1493 aa24.5■■□□□ 1.51
CFAP20-201ENST00000262498 NCAPD3P42695 1498 aa24.5■■□□□ 1.51
CFAP20-201ENST00000262498 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.33■■□□□ 1.49
CFAP20-201ENST00000262498 NESP48681 1621 aa24.32■■□□□ 1.48
CFAP20-201ENST00000262498 HMGXB3Q12766 1538 aa24.26■■□□□ 1.47
CFAP20-201ENST00000262498 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CFAP20-201ENST00000262498 SMARCA2P51531 1590 aa24.19■■□□□ 1.46
CFAP20-201ENST00000262498 SMARCA4P51532 1647 aa24.18■■□□□ 1.46
CFAP20-201ENST00000262498 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.02■■□□□ 1.44
CFAP20-201ENST00000262498 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
CFAP20-201ENST00000262498 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.01■■□□□ 1.43
CFAP20-201ENST00000262498 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.99■■□□□ 1.43
CFAP20-201ENST00000262498 TRIM41Q8WV44 630 aa23.93■■□□□ 1.42
CFAP20-201ENST00000262498 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
CFAP20-201ENST00000262498 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.82■■□□□ 1.4
CFAP20-201ENST00000262498 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.77■■□□□ 1.4
CFAP20-201ENST00000262498 WDR62O43379 1518 aa23.72■■□□□ 1.39
CFAP20-201ENST00000262498 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.7■■□□□ 1.38
CFAP20-201ENST00000262498 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.68■■□□□ 1.38
CFAP20-201ENST00000262498 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.48■■□□□ 1.35
CFAP20-201ENST00000262498 WIZO95785 1651 aa23.48■■□□□ 1.35
CFAP20-201ENST00000262498 OSCARQ8IYS5 282 aa23.44■■□□□ 1.34
CFAP20-201ENST00000262498 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.42■■□□□ 1.34
CFAP20-201ENST00000262498 CFTRP13569 1480 aa23.33■■□□□ 1.33
CFAP20-201ENST00000262498 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CFAP20-201ENST00000262498 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.32■■□□□ 1.32
CFAP20-201ENST00000262498 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.32■■□□□ 1.32
CFAP20-201ENST00000262498 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.32■■□□□ 1.32
CFAP20-201ENST00000262498 ARHGEF11O15085 1522 aa23.16■■□□□ 1.3
CFAP20-201ENST00000262498 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CFAP20-201ENST00000262498 PRDM2Q13029 1718 aa23.11■■□□□ 1.29
CFAP20-201ENST00000262498 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CFAP20-201ENST00000262498 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CFAP20-201ENST00000262498 IFT140Q96RY7 1462 aa23.02■■□□□ 1.28
CFAP20-201ENST00000262498 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CFAP20-201ENST00000262498 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.94■■□□□ 1.26
CFAP20-201ENST00000262498 TOPBP1Q92547 1522 aa22.94■■□□□ 1.26
CFAP20-201ENST00000262498 CHD1O14646 1710 aa22.93■■□□□ 1.26
CFAP20-201ENST00000262498 ARAP1Q96P48 1450 aa22.92■■□□□ 1.26
CFAP20-201ENST00000262498 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CFAP20-201ENST00000262498 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.84■■□□□ 1.25
CFAP20-201ENST00000262498 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CFAP20-201ENST00000262498 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.8■■□□□ 1.24
CFAP20-201ENST00000262498 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.246e-6■■■■□ 25.1
CFAP20-201ENST00000262498 ABCC8Q09428 1581 aa22.77■■□□□ 1.24
CFAP20-201ENST00000262498 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CFAP20-201ENST00000262498 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.65■■□□□ 1.22
CFAP20-201ENST00000262498 FBLN2P98095 1184 aa22.63■■□□□ 1.21
CFAP20-201ENST00000262498 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.6■■□□□ 1.21
CFAP20-201ENST00000262498 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CFAP20-201ENST00000262498 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.54■■□□□ 1.2
CFAP20-201ENST00000262498 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CFAP20-201ENST00000262498 SOGA1O94964 1423 aa22.5■■□□□ 1.19
CFAP20-201ENST00000262498 WDR97A6NE52 1622 aa22.49■■□□□ 1.19
CFAP20-201ENST00000262498 SYNJ1O43426 1573 aa22.48■■□□□ 1.19
CFAP20-201ENST00000262498 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CFAP20-201ENST00000262498 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.44■■□□□ 1.18
CFAP20-201ENST00000262498 SYNJ2O15056 1496 aa22.39■■□□□ 1.17
CFAP20-201ENST00000262498 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CFAP20-201ENST00000262498 GRIN2BQ13224 1484 aa22.37■■□□□ 1.17
CFAP20-201ENST00000262498 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.37■■□□□ 1.17
CFAP20-201ENST00000262498 CUX1P39880 1505 aa22.37■■□□□ 1.17
CFAP20-201ENST00000262498 PBRM1Q86U86 1689 aa22.33■■□□□ 1.17
CFAP20-201ENST00000262498 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.27■■□□□ 1.16
CFAP20-201ENST00000262498 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.22■■□□□ 1.15
CFAP20-201ENST00000262498 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.17■■□□□ 1.14
CFAP20-201ENST00000262498 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.16■■□□□ 1.14
CFAP20-201ENST00000262498 CEP170Q5SW79 1584 aa22.14■■□□□ 1.13
CFAP20-201ENST00000262498 GRIN2AQ12879 1464 aa22.12■■□□□ 1.13
CFAP20-201ENST00000262498 SHROOM2Q13796 1616 aa22.11■■□□□ 1.13
CFAP20-201ENST00000262498 NUP160Q12769 1436 aa22.09■■□□□ 1.13
CFAP20-201ENST00000262498 ADAMTS12P58397 1594 aa22.06■■□□□ 1.12
CFAP20-201ENST00000262498 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.91■■□□□ 1.1
CFAP20-201ENST00000262498 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
CFAP20-201ENST00000262498 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.87■■□□□ 1.09
CFAP20-201ENST00000262498 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CFAP20-201ENST00000262498 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.86■■□□□ 1.09
CFAP20-201ENST00000262498 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.85■■□□□ 1.09
CFAP20-201ENST00000262498 DIP2BQ9P265 1576 aa21.84■■□□□ 1.09
CFAP20-201ENST00000262498 TOP2BQ02880 1626 aa21.83■■□□□ 1.09
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