Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN6Q9Y6Q1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN6Q9Y6Q1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN6Q9Y6Q1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN6Q9Y6Q1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN6Q9Y6Q1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN6Q9Y6Q1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN6Q9Y6Q1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN6Q9Y6Q1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN6Q9Y6Q1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN6Q9Y6Q1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN6Q9Y6Q1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN6Q9Y6Q1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN6Q9Y6Q1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN6Q9Y6Q1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN6Q9Y6Q1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN6Q9Y6Q1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN6Q9Y6Q1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN6Q9Y6Q1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN6Q9Y6Q1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPN6Q9Y6Q1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CAPN6Q9Y6Q1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPN6Q9Y6Q1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPN6Q9Y6Q1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPN6Q9Y6Q1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAPN6Q9Y6Q1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN6Q9Y6Q1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN6Q9Y6Q1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN6Q9Y6Q1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN6Q9Y6Q1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN6Q9Y6Q1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN6Q9Y6Q1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN6Q9Y6Q1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN6Q9Y6Q1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPN6Q9Y6Q1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN6Q9Y6Q1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN6Q9Y6Q1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN6Q9Y6Q1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN6Q9Y6Q1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPN6Q9Y6Q1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPN6Q9Y6Q1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPN6Q9Y6Q1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CAPN6Q9Y6Q1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN6Q9Y6Q1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN6Q9Y6Q1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPN6Q9Y6Q1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPN6Q9Y6Q1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPN6Q9Y6Q1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPN6Q9Y6Q1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN6Q9Y6Q1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN6Q9Y6Q1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN6Q9Y6Q1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN6Q9Y6Q1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN6Q9Y6Q1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN6Q9Y6Q1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN6Q9Y6Q1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN6Q9Y6Q1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN6Q9Y6Q1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN6Q9Y6Q1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN6Q9Y6Q1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN6Q9Y6Q1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN6Q9Y6Q1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN6Q9Y6Q1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN6Q9Y6Q1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN6Q9Y6Q1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN6Q9Y6Q1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN6Q9Y6Q1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN6Q9Y6Q1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN6Q9Y6Q1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN6Q9Y6Q1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN6Q9Y6Q1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN6Q9Y6Q1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN6Q9Y6Q1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN6Q9Y6Q1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN6Q9Y6Q1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN6Q9Y6Q1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN6Q9Y6Q1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN6Q9Y6Q1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CAPN6Q9Y6Q1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN6Q9Y6Q1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN6Q9Y6Q1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN6Q9Y6Q1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN6Q9Y6Q1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN6Q9Y6Q1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN6Q9Y6Q1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN6Q9Y6Q1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN6Q9Y6Q1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN6Q9Y6Q1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN6Q9Y6Q1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN6Q9Y6Q1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN6Q9Y6Q1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN6Q9Y6Q1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN6Q9Y6Q1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN6Q9Y6Q1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN6Q9Y6Q1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms