Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CAPN6Q9Y6Q1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CAPN6Q9Y6Q1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CAPN6Q9Y6Q1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CAPN6Q9Y6Q1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CAPN6Q9Y6Q1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CAPN6Q9Y6Q1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CAPN6Q9Y6Q1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CAPN6Q9Y6Q1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CAPN6Q9Y6Q1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CAPN6Q9Y6Q1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CAPN6Q9Y6Q1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CAPN6Q9Y6Q1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CAPN6Q9Y6Q1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CAPN6Q9Y6Q1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CAPN6Q9Y6Q1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CAPN6Q9Y6Q1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CAPN6Q9Y6Q1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CAPN6Q9Y6Q1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CAPN6Q9Y6Q1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CAPN6Q9Y6Q1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CAPN6Q9Y6Q1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CAPN6Q9Y6Q1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CAPN6Q9Y6Q1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CAPN6Q9Y6Q1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CAPN6Q9Y6Q1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CAPN6Q9Y6Q1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CAPN6Q9Y6Q1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CAPN6Q9Y6Q1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CAPN6Q9Y6Q1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CAPN6Q9Y6Q1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CAPN6Q9Y6Q1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CAPN6Q9Y6Q1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CAPN6Q9Y6Q1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CAPN6Q9Y6Q1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CAPN6Q9Y6Q1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CAPN6Q9Y6Q1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CAPN6Q9Y6Q1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CAPN6Q9Y6Q1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CAPN6Q9Y6Q1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CAPN6Q9Y6Q1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CAPN6Q9Y6Q1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CAPN6Q9Y6Q1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CAPN6Q9Y6Q1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CAPN6Q9Y6Q1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CAPN6Q9Y6Q1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CAPN6Q9Y6Q1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CAPN6Q9Y6Q1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CAPN6Q9Y6Q1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CAPN6Q9Y6Q1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CAPN6Q9Y6Q1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CAPN6Q9Y6Q1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CAPN6Q9Y6Q1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CAPN6Q9Y6Q1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CAPN6Q9Y6Q1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CAPN6Q9Y6Q1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CAPN6Q9Y6Q1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CAPN6Q9Y6Q1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CAPN6Q9Y6Q1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CAPN6Q9Y6Q1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CAPN6Q9Y6Q1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CAPN6Q9Y6Q1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CAPN6Q9Y6Q1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CAPN6Q9Y6Q1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CAPN6Q9Y6Q1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CAPN6Q9Y6Q1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CAPN6Q9Y6Q1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CAPN6Q9Y6Q1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CAPN6Q9Y6Q1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CAPN6Q9Y6Q1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CAPN6Q9Y6Q1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CAPN6Q9Y6Q1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CAPN6Q9Y6Q1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CAPN6Q9Y6Q1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CAPN6Q9Y6Q1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CAPN6Q9Y6Q1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CAPN6Q9Y6Q1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CAPN6Q9Y6Q1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CAPN6Q9Y6Q1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CAPN6Q9Y6Q1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CAPN6Q9Y6Q1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CAPN6Q9Y6Q1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CAPN6Q9Y6Q1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CAPN6Q9Y6Q1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CAPN6Q9Y6Q1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CAPN6Q9Y6Q1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CAPN6Q9Y6Q1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CAPN6Q9Y6Q1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CAPN6Q9Y6Q1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CAPN6Q9Y6Q1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CAPN6Q9Y6Q1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CAPN6Q9Y6Q1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CAPN6Q9Y6Q1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CAPN6Q9Y6Q1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CAPN6Q9Y6Q1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms