Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R0

COA3, Cytochrome c oxidase assembly factor 3 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA3Q9Y2R0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COA3Q9Y2R0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COA3Q9Y2R0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COA3Q9Y2R0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COA3Q9Y2R0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COA3Q9Y2R0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COA3Q9Y2R0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COA3Q9Y2R0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COA3Q9Y2R0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COA3Q9Y2R0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COA3Q9Y2R0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COA3Q9Y2R0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COA3Q9Y2R0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COA3Q9Y2R0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COA3Q9Y2R0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COA3Q9Y2R0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COA3Q9Y2R0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COA3Q9Y2R0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms