Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R0

COA3, Cytochrome c oxidase assembly factor 3 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA3Q9Y2R0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
COA3Q9Y2R0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
COA3Q9Y2R0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
COA3Q9Y2R0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
COA3Q9Y2R0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COA3Q9Y2R0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COA3Q9Y2R0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COA3Q9Y2R0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COA3Q9Y2R0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COA3Q9Y2R0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
COA3Q9Y2R0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COA3Q9Y2R0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COA3Q9Y2R0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COA3Q9Y2R0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COA3Q9Y2R0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COA3Q9Y2R0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COA3Q9Y2R0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COA3Q9Y2R0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COA3Q9Y2R0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
COA3Q9Y2R0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COA3Q9Y2R0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COA3Q9Y2R0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COA3Q9Y2R0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COA3Q9Y2R0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COA3Q9Y2R0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COA3Q9Y2R0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COA3Q9Y2R0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COA3Q9Y2R0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COA3Q9Y2R0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COA3Q9Y2R0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COA3Q9Y2R0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COA3Q9Y2R0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COA3Q9Y2R0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COA3Q9Y2R0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COA3Q9Y2R0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
COA3Q9Y2R0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COA3Q9Y2R0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COA3Q9Y2R0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COA3Q9Y2R0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COA3Q9Y2R0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COA3Q9Y2R0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COA3Q9Y2R0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COA3Q9Y2R0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COA3Q9Y2R0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COA3Q9Y2R0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COA3Q9Y2R0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COA3Q9Y2R0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COA3Q9Y2R0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COA3Q9Y2R0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COA3Q9Y2R0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COA3Q9Y2R0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COA3Q9Y2R0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COA3Q9Y2R0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COA3Q9Y2R0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COA3Q9Y2R0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COA3Q9Y2R0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COA3Q9Y2R0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COA3Q9Y2R0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COA3Q9Y2R0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COA3Q9Y2R0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COA3Q9Y2R0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COA3Q9Y2R0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COA3Q9Y2R0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COA3Q9Y2R0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COA3Q9Y2R0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COA3Q9Y2R0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COA3Q9Y2R0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COA3Q9Y2R0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COA3Q9Y2R0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COA3Q9Y2R0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COA3Q9Y2R0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COA3Q9Y2R0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COA3Q9Y2R0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COA3Q9Y2R0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
COA3Q9Y2R0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COA3Q9Y2R0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
COA3Q9Y2R0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COA3Q9Y2R0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COA3Q9Y2R0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COA3Q9Y2R0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COA3Q9Y2R0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COA3Q9Y2R0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COA3Q9Y2R0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COA3Q9Y2R0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COA3Q9Y2R0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COA3Q9Y2R0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COA3Q9Y2R0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COA3Q9Y2R0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COA3Q9Y2R0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COA3Q9Y2R0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COA3Q9Y2R0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COA3Q9Y2R0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COA3Q9Y2R0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COA3Q9Y2R0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COA3Q9Y2R0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COA3Q9Y2R0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COA3Q9Y2R0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COA3Q9Y2R0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COA3Q9Y2R0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COA3Q9Y2R0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms