Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y287

ITM2B, Integral membrane protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2BQ9Y287 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITM2BQ9Y287 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITM2BQ9Y287 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITM2BQ9Y287 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITM2BQ9Y287 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITM2BQ9Y287 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITM2BQ9Y287 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITM2BQ9Y287 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITM2BQ9Y287 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITM2BQ9Y287 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITM2BQ9Y287 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITM2BQ9Y287 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITM2BQ9Y287 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITM2BQ9Y287 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITM2BQ9Y287 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITM2BQ9Y287 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ITM2BQ9Y287 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITM2BQ9Y287 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITM2BQ9Y287 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITM2BQ9Y287 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITM2BQ9Y287 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITM2BQ9Y287 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITM2BQ9Y287 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITM2BQ9Y287 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITM2BQ9Y287 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITM2BQ9Y287 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITM2BQ9Y287 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITM2BQ9Y287 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITM2BQ9Y287 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITM2BQ9Y287 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ITM2BQ9Y287 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ITM2BQ9Y287 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITM2BQ9Y287 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITM2BQ9Y287 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITM2BQ9Y287 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITM2BQ9Y287 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITM2BQ9Y287 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITM2BQ9Y287 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITM2BQ9Y287 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITM2BQ9Y287 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ITM2BQ9Y287 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITM2BQ9Y287 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITM2BQ9Y287 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITM2BQ9Y287 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITM2BQ9Y287 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITM2BQ9Y287 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITM2BQ9Y287 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITM2BQ9Y287 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITM2BQ9Y287 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITM2BQ9Y287 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms