Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TNNQ9UQP3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TNNQ9UQP3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TNNQ9UQP3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TNNQ9UQP3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TNNQ9UQP3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TNNQ9UQP3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
TNNQ9UQP3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
TNNQ9UQP3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TNNQ9UQP3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TNNQ9UQP3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TNNQ9UQP3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TNNQ9UQP3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TNNQ9UQP3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TNNQ9UQP3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
TNNQ9UQP3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNNQ9UQP3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNNQ9UQP3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNNQ9UQP3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNNQ9UQP3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNNQ9UQP3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNNQ9UQP3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNNQ9UQP3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
TNNQ9UQP3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNNQ9UQP3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
TNNQ9UQP3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TNNQ9UQP3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNNQ9UQP3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNNQ9UQP3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNNQ9UQP3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNNQ9UQP3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNNQ9UQP3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNNQ9UQP3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNNQ9UQP3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNNQ9UQP3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNNQ9UQP3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNNQ9UQP3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
TNNQ9UQP3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TNNQ9UQP3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TNNQ9UQP3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TNNQ9UQP3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNNQ9UQP3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNNQ9UQP3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNNQ9UQP3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
TNNQ9UQP3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
TNNQ9UQP3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNNQ9UQP3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNNQ9UQP3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNNQ9UQP3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNNQ9UQP3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNNQ9UQP3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNNQ9UQP3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNNQ9UQP3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNNQ9UQP3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNNQ9UQP3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNNQ9UQP3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TNNQ9UQP3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TNNQ9UQP3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNNQ9UQP3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNNQ9UQP3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNNQ9UQP3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNNQ9UQP3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNNQ9UQP3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TNNQ9UQP3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TNNQ9UQP3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNNQ9UQP3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNNQ9UQP3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TNNQ9UQP3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TNNQ9UQP3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TNNQ9UQP3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
TNNQ9UQP3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TNNQ9UQP3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TNNQ9UQP3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TNNQ9UQP3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TNNQ9UQP3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TNNQ9UQP3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TNNQ9UQP3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms