Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDH22Q9UJ99 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDH22Q9UJ99 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH22Q9UJ99 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH22Q9UJ99 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH22Q9UJ99 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH22Q9UJ99 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH22Q9UJ99 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH22Q9UJ99 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDH22Q9UJ99 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDH22Q9UJ99 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDH22Q9UJ99 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDH22Q9UJ99 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDH22Q9UJ99 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CDH22Q9UJ99 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDH22Q9UJ99 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDH22Q9UJ99 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDH22Q9UJ99 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CDH22Q9UJ99 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDH22Q9UJ99 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDH22Q9UJ99 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDH22Q9UJ99 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CDH22Q9UJ99 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDH22Q9UJ99 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDH22Q9UJ99 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDH22Q9UJ99 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDH22Q9UJ99 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDH22Q9UJ99 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CDH22Q9UJ99 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDH22Q9UJ99 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDH22Q9UJ99 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDH22Q9UJ99 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH22Q9UJ99 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH22Q9UJ99 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH22Q9UJ99 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH22Q9UJ99 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH22Q9UJ99 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH22Q9UJ99 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH22Q9UJ99 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH22Q9UJ99 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH22Q9UJ99 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDH22Q9UJ99 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDH22Q9UJ99 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDH22Q9UJ99 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDH22Q9UJ99 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CDH22Q9UJ99 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDH22Q9UJ99 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDH22Q9UJ99 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDH22Q9UJ99 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDH22Q9UJ99 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDH22Q9UJ99 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDH22Q9UJ99 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDH22Q9UJ99 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDH22Q9UJ99 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDH22Q9UJ99 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDH22Q9UJ99 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CDH22Q9UJ99 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDH22Q9UJ99 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDH22Q9UJ99 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDH22Q9UJ99 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CDH22Q9UJ99 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH22Q9UJ99 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH22Q9UJ99 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH22Q9UJ99 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH22Q9UJ99 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDH22Q9UJ99 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDH22Q9UJ99 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDH22Q9UJ99 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDH22Q9UJ99 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDH22Q9UJ99 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDH22Q9UJ99 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CDH22Q9UJ99 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDH22Q9UJ99 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH22Q9UJ99 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH22Q9UJ99 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH22Q9UJ99 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH22Q9UJ99 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDH22Q9UJ99 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDH22Q9UJ99 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDH22Q9UJ99 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDH22Q9UJ99 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDH22Q9UJ99 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDH22Q9UJ99 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDH22Q9UJ99 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CDH22Q9UJ99 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH22Q9UJ99 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH22Q9UJ99 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH22Q9UJ99 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH22Q9UJ99 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH22Q9UJ99 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH22Q9UJ99 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH22Q9UJ99 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDH22Q9UJ99 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDH22Q9UJ99 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDH22Q9UJ99 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDH22Q9UJ99 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH22Q9UJ99 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH22Q9UJ99 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH22Q9UJ99 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH22Q9UJ99 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms