Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CDH22Q9UJ99 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CDH22Q9UJ99 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CDH22Q9UJ99 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CDH22Q9UJ99 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CDH22Q9UJ99 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CDH22Q9UJ99 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CDH22Q9UJ99 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
CDH22Q9UJ99 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CDH22Q9UJ99 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CDH22Q9UJ99 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CDH22Q9UJ99 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CDH22Q9UJ99 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CDH22Q9UJ99 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CDH22Q9UJ99 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDH22Q9UJ99 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CDH22Q9UJ99 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDH22Q9UJ99 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDH22Q9UJ99 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CDH22Q9UJ99 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CDH22Q9UJ99 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CDH22Q9UJ99 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CDH22Q9UJ99 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDH22Q9UJ99 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CDH22Q9UJ99 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CDH22Q9UJ99 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CDH22Q9UJ99 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CDH22Q9UJ99 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CDH22Q9UJ99 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CDH22Q9UJ99 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CDH22Q9UJ99 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CDH22Q9UJ99 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CDH22Q9UJ99 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CDH22Q9UJ99 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
CDH22Q9UJ99 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
CDH22Q9UJ99 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CDH22Q9UJ99 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CDH22Q9UJ99 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CDH22Q9UJ99 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CDH22Q9UJ99 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CDH22Q9UJ99 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CDH22Q9UJ99 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CDH22Q9UJ99 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CDH22Q9UJ99 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CDH22Q9UJ99 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDH22Q9UJ99 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CDH22Q9UJ99 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDH22Q9UJ99 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CDH22Q9UJ99 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDH22Q9UJ99 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CDH22Q9UJ99 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CDH22Q9UJ99 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CDH22Q9UJ99 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CDH22Q9UJ99 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDH22Q9UJ99 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDH22Q9UJ99 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CDH22Q9UJ99 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CDH22Q9UJ99 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CDH22Q9UJ99 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CDH22Q9UJ99 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CDH22Q9UJ99 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CDH22Q9UJ99 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CDH22Q9UJ99 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CDH22Q9UJ99 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDH22Q9UJ99 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDH22Q9UJ99 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CDH22Q9UJ99 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CDH22Q9UJ99 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CDH22Q9UJ99 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDH22Q9UJ99 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CDH22Q9UJ99 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CDH22Q9UJ99 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CDH22Q9UJ99 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CDH22Q9UJ99 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CDH22Q9UJ99 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CDH22Q9UJ99 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CDH22Q9UJ99 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDH22Q9UJ99 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CDH22Q9UJ99 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
CDH22Q9UJ99 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDH22Q9UJ99 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CDH22Q9UJ99 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CDH22Q9UJ99 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CDH22Q9UJ99 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CDH22Q9UJ99 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CDH22Q9UJ99 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDH22Q9UJ99 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDH22Q9UJ99 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CDH22Q9UJ99 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CDH22Q9UJ99 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CDH22Q9UJ99 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CDH22Q9UJ99 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CDH22Q9UJ99 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDH22Q9UJ99 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
CDH22Q9UJ99 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CDH22Q9UJ99 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CDH22Q9UJ99 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CDH22Q9UJ99 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CDH22Q9UJ99 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CDH22Q9UJ99 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms