Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTN3Q9P232 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTN3Q9P232 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNTN3Q9P232 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CNTN3Q9P232 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTN3Q9P232 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTN3Q9P232 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTN3Q9P232 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTN3Q9P232 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTN3Q9P232 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTN3Q9P232 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTN3Q9P232 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTN3Q9P232 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTN3Q9P232 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTN3Q9P232 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTN3Q9P232 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTN3Q9P232 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTN3Q9P232 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTN3Q9P232 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNTN3Q9P232 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CNTN3Q9P232 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNTN3Q9P232 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTN3Q9P232 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNTN3Q9P232 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTN3Q9P232 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTN3Q9P232 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTN3Q9P232 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNTN3Q9P232 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTN3Q9P232 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTN3Q9P232 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTN3Q9P232 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTN3Q9P232 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNTN3Q9P232 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTN3Q9P232 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNTN3Q9P232 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNTN3Q9P232 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNTN3Q9P232 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNTN3Q9P232 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNTN3Q9P232 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms