Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSD3Q9NYI0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSD3Q9NYI0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSD3Q9NYI0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PSD3Q9NYI0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSD3Q9NYI0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSD3Q9NYI0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSD3Q9NYI0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSD3Q9NYI0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSD3Q9NYI0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSD3Q9NYI0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSD3Q9NYI0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSD3Q9NYI0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSD3Q9NYI0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSD3Q9NYI0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PSD3Q9NYI0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSD3Q9NYI0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PSD3Q9NYI0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSD3Q9NYI0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSD3Q9NYI0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSD3Q9NYI0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSD3Q9NYI0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSD3Q9NYI0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSD3Q9NYI0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSD3Q9NYI0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSD3Q9NYI0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSD3Q9NYI0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSD3Q9NYI0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSD3Q9NYI0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSD3Q9NYI0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSD3Q9NYI0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSD3Q9NYI0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PSD3Q9NYI0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSD3Q9NYI0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSD3Q9NYI0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSD3Q9NYI0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSD3Q9NYI0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSD3Q9NYI0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSD3Q9NYI0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSD3Q9NYI0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSD3Q9NYI0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSD3Q9NYI0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSD3Q9NYI0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSD3Q9NYI0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSD3Q9NYI0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSD3Q9NYI0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSD3Q9NYI0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSD3Q9NYI0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSD3Q9NYI0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSD3Q9NYI0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSD3Q9NYI0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSD3Q9NYI0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSD3Q9NYI0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSD3Q9NYI0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSD3Q9NYI0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSD3Q9NYI0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSD3Q9NYI0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSD3Q9NYI0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSD3Q9NYI0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSD3Q9NYI0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSD3Q9NYI0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSD3Q9NYI0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSD3Q9NYI0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSD3Q9NYI0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSD3Q9NYI0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSD3Q9NYI0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSD3Q9NYI0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSD3Q9NYI0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSD3Q9NYI0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSD3Q9NYI0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSD3Q9NYI0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSD3Q9NYI0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSD3Q9NYI0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSD3Q9NYI0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSD3Q9NYI0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSD3Q9NYI0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms