Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNIP2Q9NS61 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNIP2Q9NS61 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNIP2Q9NS61 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNIP2Q9NS61 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNIP2Q9NS61 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNIP2Q9NS61 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNIP2Q9NS61 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNIP2Q9NS61 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNIP2Q9NS61 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNIP2Q9NS61 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNIP2Q9NS61 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNIP2Q9NS61 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNIP2Q9NS61 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNIP2Q9NS61 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNIP2Q9NS61 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP2Q9NS61 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP2Q9NS61 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP2Q9NS61 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP2Q9NS61 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP2Q9NS61 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP2Q9NS61 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNIP2Q9NS61 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNIP2Q9NS61 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNIP2Q9NS61 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNIP2Q9NS61 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms