Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 FOXP1-217ENST00000498154 535 ntTSL 318.84■□□□□ 0.614e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 DDX3X-214ENST00000622373 2129 nt18.19■□□□□ 0.54e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.484e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.423e-11■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 CD164-208ENST00000506649 778 ntTSL 316.71■□□□□ 0.277e-9■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.224e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.124e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 DDX3X-210ENST00000615313 568 ntTSL 415.02■□□□□ -04e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.013e-11■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.025e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 DDX3X-206ENST00000542215 1592 ntTSL 214.14□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 DDX3X-213ENST00000622198 409 ntTSL 413.63□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 DDX3X-208ENST00000611546 442 ntTSL 513.63□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.285e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 JMJD1C-211ENST00000633035 499 ntTSL 313.07□□□□□ -0.327e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.344e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.344e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.434e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 PDCD6-211ENST00000515587 855 ntTSL 1 (best)12.33□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SPIDR-214ENST00000521550 1849 ntTSL 212.29□□□□□ -0.445e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.494e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.534e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 CD164-209ENST00000512212 590 ntTSL 211.61□□□□□ -0.555e-9■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.555e-9■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.564e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SPG7-205ENST00000561945 411 ntTSL 311.49□□□□□ -0.574e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SPG7-207ENST00000563218 654 ntTSL 510.91□□□□□ -0.664e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SPIDR-217ENST00000522117 2745 ntTSL 210.74□□□□□ -0.695e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 CD164-204ENST00000413644 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.745e-9■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SPIDR-211ENST00000519401 2090 ntTSL 210.2□□□□□ -0.785e-8■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 GDI2-209ENST00000609712 622 ntTSL 310.1□□□□□ -0.794e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SLC25A26-205ENST00000483224 1840 ntTSL 510.05□□□□□ -0.84e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 DDX3X-203ENST00000457138 5346 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 GDI2-206ENST00000456041 918 ntTSL 59.78□□□□□ -0.844e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.864e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SPIDR-222ENST00000524006 970 ntTSL 59.35□□□□□ -0.915e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 GDI2-204ENST00000418688 636 ntTSL 59.35□□□□□ -0.914e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 GDI2-202ENST00000380181 1408 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.924e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SPIDR-212ENST00000519661 1035 ntTSL 29.33□□□□□ -0.925e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SPIDR-206ENST00000518074 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.925e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 DDX3X-217ENST00000629496 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.941e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SPIDR-225ENST00000524141 2761 ntTSL 29.09□□□□□ -0.955e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 DDX3X-215ENST00000625837 3237 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SPIDR-224ENST00000524126 2614 ntTSL 1 (best)8.99□□□□□ -0.975e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 CD164-202ENST00000310786 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.985e-9■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 FOXP1-209ENST00000475937 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.994e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 DDX3X-216ENST00000626301 3013 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -11e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 DDX3X-218ENST00000629785 3457 ntTSL 58.8□□□□□ -11e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 DDX3X-219ENST00000630255 3289 ntTSL 58.75□□□□□ -1.011e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 DDX3X-221ENST00000630858 3181 ntTSL 58.73□□□□□ -1.011e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 DSE-203ENST00000430252 1130 ntTSL 28.68□□□□□ -1.024e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 DDX3X-204ENST00000478993 3397 ntTSL 1 (best)8.53□□□□□ -1.041e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 CD164-203ENST00000324953 2936 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.075e-9■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 DDX3X-220ENST00000630370 3120 ntTSL 58.28□□□□□ -1.081e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 CD164-201ENST00000275080 2954 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.125e-9■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SLC25A26-204ENST00000464350 3879 ntTSL 1 (best)7.65□□□□□ -1.184e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 DDX3X-207ENST00000610559 542 ntTSL 47.58□□□□□ -1.21e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SLC25A26-203ENST00000413054 1096 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.214e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SLC25A26-206ENST00000484768 375 ntTSL 37.45□□□□□ -1.224e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 VPS13B-206ENST00000496144 5625 ntTSL 57.25□□□□□ -1.253e-11■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 GDI2-208ENST00000608581 634 ntTSL 37.22□□□□□ -1.254e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SPIDR-213ENST00000521214 3577 ntTSL 26.96□□□□□ -1.295e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 DDX3X-222ENST00000631641 583 ntTSL 36.88□□□□□ -1.311e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SPIDR-223ENST00000524033 1023 ntTSL 26.87□□□□□ -1.315e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 GDI2-201ENST00000380127 584 ntTSL 36.8□□□□□ -1.324e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SND1-206ENST00000468166 552 ntTSL 46.79□□□□□ -1.323e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 DDX3X-211ENST00000615742 485 ntTSL 46.72□□□□□ -1.331e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 DDX3X-202ENST00000441189 1051 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.331e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 DDX3X-205ENST00000480592 1001 ntTSL 1 (best)6.23□□□□□ -1.411e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.444e-6■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.443e-11■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 SND1-204ENST00000465900 630 ntTSL 45.82□□□□□ -1.483e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.53e-11■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 CTNNB1-209ENST00000450969 645 ntTSL 44.42□□□□□ -1.74e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.548e-8■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 TPTEP1-202ENST00000400593 1430 ntTSL 1 (best)13.1□□□□□ -0.318e-8■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 TPTEP1-204ENST00000426585 5725 ntTSL 1 (best)11.71□□□□□ -0.538e-8■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 GALK2-216ENST00000560031 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.784e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 GALK2-220ENST00000560654 784 ntTSL 510.12□□□□□ -0.793e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 GALK2-212ENST00000559454 1768 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.884e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 GALK2-202ENST00000396509 1834 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.964e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 GALK2-215ENST00000559963 794 ntTSL 28.59□□□□□ -1.033e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 GALK2-217ENST00000560119 2053 ntTSL 28.54□□□□□ -1.044e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 GALK2-203ENST00000544523 1950 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 GALK2-211ENST00000559423 895 ntTSL 58.02□□□□□ -1.133e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 GALK2-218ENST00000560138 722 ntTSL 57.73□□□□□ -1.173e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 GALK2-204ENST00000558145 567 ntTSL 47.53□□□□□ -1.23e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 GALK2-214ENST00000559883 991 ntTSL 47.13□□□□□ -1.273e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 GALK2-206ENST00000558775 813 ntTSL 37.13□□□□□ -1.273e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.34e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 GALK2-210ENST00000559208 861 ntTSL 56.28□□□□□ -1.43e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 GALK2-207ENST00000558956 641 ntTSL 56.19□□□□□ -1.423e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 41.3
EXOSC5Q9NQT4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 41.3
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