Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCX3

ZNF304, Zinc finger protein 304, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF304Q9HCX3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF304Q9HCX3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF304Q9HCX3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF304Q9HCX3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF304Q9HCX3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF304Q9HCX3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF304Q9HCX3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF304Q9HCX3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF304Q9HCX3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF304Q9HCX3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF304Q9HCX3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF304Q9HCX3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF304Q9HCX3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF304Q9HCX3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF304Q9HCX3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF304Q9HCX3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF304Q9HCX3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF304Q9HCX3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF304Q9HCX3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF304Q9HCX3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF304Q9HCX3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF304Q9HCX3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF304Q9HCX3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF304Q9HCX3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF304Q9HCX3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF304Q9HCX3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF304Q9HCX3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF304Q9HCX3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF304Q9HCX3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF304Q9HCX3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF304Q9HCX3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF304Q9HCX3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF304Q9HCX3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF304Q9HCX3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF304Q9HCX3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF304Q9HCX3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF304Q9HCX3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF304Q9HCX3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF304Q9HCX3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF304Q9HCX3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF304Q9HCX3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF304Q9HCX3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF304Q9HCX3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF304Q9HCX3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF304Q9HCX3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF304Q9HCX3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF304Q9HCX3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF304Q9HCX3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF304Q9HCX3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF304Q9HCX3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF304Q9HCX3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF304Q9HCX3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF304Q9HCX3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF304Q9HCX3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF304Q9HCX3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF304Q9HCX3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF304Q9HCX3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF304Q9HCX3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF304Q9HCX3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms