Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPS7BQ9H9Q2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COPS7BQ9H9Q2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPS7BQ9H9Q2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPS7BQ9H9Q2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS7BQ9H9Q2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS7BQ9H9Q2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS7BQ9H9Q2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS7BQ9H9Q2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS7BQ9H9Q2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPS7BQ9H9Q2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPS7BQ9H9Q2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPS7BQ9H9Q2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPS7BQ9H9Q2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS7BQ9H9Q2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS7BQ9H9Q2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS7BQ9H9Q2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS7BQ9H9Q2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS7BQ9H9Q2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS7BQ9H9Q2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS7BQ9H9Q2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS7BQ9H9Q2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS7BQ9H9Q2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS7BQ9H9Q2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS7BQ9H9Q2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS7BQ9H9Q2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS7BQ9H9Q2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS7BQ9H9Q2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS7BQ9H9Q2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS7BQ9H9Q2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPS7BQ9H9Q2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPS7BQ9H9Q2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPS7BQ9H9Q2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPS7BQ9H9Q2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPS7BQ9H9Q2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPS7BQ9H9Q2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPS7BQ9H9Q2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPS7BQ9H9Q2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPS7BQ9H9Q2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
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