Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLSTN2Q9H4D0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLSTN2Q9H4D0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CLSTN2Q9H4D0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CLSTN2Q9H4D0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLSTN2Q9H4D0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLSTN2Q9H4D0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLSTN2Q9H4D0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLSTN2Q9H4D0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLSTN2Q9H4D0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLSTN2Q9H4D0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLSTN2Q9H4D0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLSTN2Q9H4D0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLSTN2Q9H4D0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLSTN2Q9H4D0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CLSTN2Q9H4D0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLSTN2Q9H4D0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLSTN2Q9H4D0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLSTN2Q9H4D0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLSTN2Q9H4D0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLSTN2Q9H4D0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CLSTN2Q9H4D0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLSTN2Q9H4D0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLSTN2Q9H4D0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLSTN2Q9H4D0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLSTN2Q9H4D0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSTN2Q9H4D0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSTN2Q9H4D0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSTN2Q9H4D0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSTN2Q9H4D0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSTN2Q9H4D0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLSTN2Q9H4D0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLSTN2Q9H4D0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLSTN2Q9H4D0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLSTN2Q9H4D0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLSTN2Q9H4D0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLSTN2Q9H4D0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLSTN2Q9H4D0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLSTN2Q9H4D0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLSTN2Q9H4D0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSTN2Q9H4D0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSTN2Q9H4D0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLSTN2Q9H4D0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLSTN2Q9H4D0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLSTN2Q9H4D0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLSTN2Q9H4D0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLSTN2Q9H4D0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLSTN2Q9H4D0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSTN2Q9H4D0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSTN2Q9H4D0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSTN2Q9H4D0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSTN2Q9H4D0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLSTN2Q9H4D0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLSTN2Q9H4D0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLSTN2Q9H4D0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLSTN2Q9H4D0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLSTN2Q9H4D0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLSTN2Q9H4D0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLSTN2Q9H4D0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CLSTN2Q9H4D0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLSTN2Q9H4D0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLSTN2Q9H4D0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLSTN2Q9H4D0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSTN2Q9H4D0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSTN2Q9H4D0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSTN2Q9H4D0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLSTN2Q9H4D0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLSTN2Q9H4D0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLSTN2Q9H4D0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLSTN2Q9H4D0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLSTN2Q9H4D0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLSTN2Q9H4D0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSTN2Q9H4D0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSTN2Q9H4D0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLSTN2Q9H4D0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSTN2Q9H4D0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSTN2Q9H4D0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSTN2Q9H4D0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSTN2Q9H4D0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSTN2Q9H4D0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSTN2Q9H4D0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSTN2Q9H4D0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLSTN2Q9H4D0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSTN2Q9H4D0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSTN2Q9H4D0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLSTN2Q9H4D0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms