Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM8Q9BZR9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM8Q9BZR9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM8Q9BZR9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM8Q9BZR9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms