Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBB6Q9BUF5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TUBB6Q9BUF5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB6Q9BUF5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB6Q9BUF5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB6Q9BUF5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB6Q9BUF5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB6Q9BUF5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB6Q9BUF5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB6Q9BUF5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB6Q9BUF5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB6Q9BUF5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB6Q9BUF5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB6Q9BUF5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB6Q9BUF5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB6Q9BUF5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB6Q9BUF5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB6Q9BUF5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB6Q9BUF5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB6Q9BUF5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB6Q9BUF5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB6Q9BUF5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB6Q9BUF5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TUBB6Q9BUF5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBB6Q9BUF5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150 ms