Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ0

PYGO2, Pygopus homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGO2Q9BRQ0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PYGO2Q9BRQ0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PYGO2Q9BRQ0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PYGO2Q9BRQ0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PYGO2Q9BRQ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PYGO2Q9BRQ0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PYGO2Q9BRQ0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PYGO2Q9BRQ0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PYGO2Q9BRQ0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PYGO2Q9BRQ0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PYGO2Q9BRQ0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PYGO2Q9BRQ0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PYGO2Q9BRQ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PYGO2Q9BRQ0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PYGO2Q9BRQ0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PYGO2Q9BRQ0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PYGO2Q9BRQ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PYGO2Q9BRQ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms