Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACAP3Q96P50 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACAP3Q96P50 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACAP3Q96P50 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACAP3Q96P50 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACAP3Q96P50 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACAP3Q96P50 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACAP3Q96P50 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACAP3Q96P50 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACAP3Q96P50 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ACAP3Q96P50 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ACAP3Q96P50 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACAP3Q96P50 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACAP3Q96P50 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACAP3Q96P50 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACAP3Q96P50 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACAP3Q96P50 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACAP3Q96P50 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACAP3Q96P50 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACAP3Q96P50 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACAP3Q96P50 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACAP3Q96P50 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACAP3Q96P50 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ACAP3Q96P50 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACAP3Q96P50 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACAP3Q96P50 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACAP3Q96P50 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACAP3Q96P50 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACAP3Q96P50 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ACAP3Q96P50 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACAP3Q96P50 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACAP3Q96P50 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACAP3Q96P50 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ACAP3Q96P50 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ACAP3Q96P50 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ACAP3Q96P50 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ACAP3Q96P50 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ACAP3Q96P50 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACAP3Q96P50 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ACAP3Q96P50 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACAP3Q96P50 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ACAP3Q96P50 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACAP3Q96P50 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACAP3Q96P50 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACAP3Q96P50 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACAP3Q96P50 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACAP3Q96P50 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACAP3Q96P50 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACAP3Q96P50 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACAP3Q96P50 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACAP3Q96P50 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACAP3Q96P50 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACAP3Q96P50 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACAP3Q96P50 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACAP3Q96P50 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACAP3Q96P50 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACAP3Q96P50 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACAP3Q96P50 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACAP3Q96P50 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACAP3Q96P50 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACAP3Q96P50 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ACAP3Q96P50 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACAP3Q96P50 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACAP3Q96P50 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACAP3Q96P50 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACAP3Q96P50 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACAP3Q96P50 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ACAP3Q96P50 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ACAP3Q96P50 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.3 ms