Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC5

MRPL48, 39S ribosomal protein L48, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL48Q96GC5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL48Q96GC5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MRPL48Q96GC5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRPL48Q96GC5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRPL48Q96GC5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRPL48Q96GC5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms