Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB3CQ96E17 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3CQ96E17 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB3CQ96E17 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3CQ96E17 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3CQ96E17 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3CQ96E17 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3CQ96E17 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3CQ96E17 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3CQ96E17 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3CQ96E17 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3CQ96E17 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3CQ96E17 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3CQ96E17 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3CQ96E17 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3CQ96E17 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3CQ96E17 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3CQ96E17 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3CQ96E17 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3CQ96E17 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3CQ96E17 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3CQ96E17 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3CQ96E17 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3CQ96E17 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms