Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF653Q96CK0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZNF653Q96CK0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF653Q96CK0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF653Q96CK0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF653Q96CK0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF653Q96CK0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF653Q96CK0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF653Q96CK0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF653Q96CK0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF653Q96CK0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF653Q96CK0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF653Q96CK0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF653Q96CK0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF653Q96CK0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF653Q96CK0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF653Q96CK0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ZNF653Q96CK0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF653Q96CK0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF653Q96CK0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF653Q96CK0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF653Q96CK0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF653Q96CK0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF653Q96CK0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF653Q96CK0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF653Q96CK0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms