Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFT1Q96AA3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFT1Q96AA3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFT1Q96AA3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFT1Q96AA3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFT1Q96AA3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFT1Q96AA3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFT1Q96AA3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFT1Q96AA3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFT1Q96AA3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFT1Q96AA3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFT1Q96AA3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFT1Q96AA3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFT1Q96AA3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFT1Q96AA3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RFT1Q96AA3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFT1Q96AA3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFT1Q96AA3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFT1Q96AA3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFT1Q96AA3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFT1Q96AA3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFT1Q96AA3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFT1Q96AA3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFT1Q96AA3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFT1Q96AA3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFT1Q96AA3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFT1Q96AA3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFT1Q96AA3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFT1Q96AA3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFT1Q96AA3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFT1Q96AA3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFT1Q96AA3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms